Приём, оказанный теориям Доннелли, полностью его разочаровал.

Кэтрин в переписке напоминала,

чтобы в частных и публичных ответах на критику он обращал внимание только на содержательные
моменты и не переходил на личности. В дневнике Игнатиус жаловался, что несчастья преследуют его
уже двадцать лет подряд. Владелец поместья Бэкона отказался разрешать раскопки, чтобы отыскать
тайные рукописи. Впав в депрессию от дождливого лондонского лета, Доннелли с сыном решили
посетить малую родину их предков в Ирландию. По пути они заехали в Шотландию и осмотрели
дом Роберта Бёрнса. В дневнике Игнатиус проклинал «папистов и оранжистов, которые держат людей
моей крови в постоянной нищете, без удобств, удовольствий и просвещения». Впечатления были
мрачными: Ирландия оказалась «проклятой землей» с «проклятым народом», вдобавок, Доннелли
угнетала мысль о возвращении в США, где он ожидал насмешек над своей теорией. Тем не менее,
оказавшись 2 августа на борту парохода «Умбрия», Доннелли писал жене, что «не отдал бы Миннесоту
за всю Британскую империю», не скрывая радости, что навсегда покидает эту «снобистскую,
фанатическую, сословную, полузатопленную страну»[51].
К январю 1889 года интерес к «Великой криптограмме» угас и в США. Суммарная прибыль от книги
составила 8194 доллара 37 центов (не считая четырёхтысячного аванса), но Доннелли подозревал
Пила в махинациях и утаивании дохода. Издатель настаивал, что Игнатиус должен лично продвигать
книгу и ездить с лекциями по стране; сам Доннелли обратился к агентству Пинкертона для проведения
независимого аудита издательства, книжного склада и распространителей. Наконец, Пил подал на
Доннелли в суд, требуя возмещения убытков. В конце концов автор выкупил печатные формы, и
поклялся, что построит у себя в саду павильон для их хранения, «как памятник грандиозного провала».
Тем не менее скандалы вокруг книги оживили интерес к Доннелли, и он сделался востребованным
лектором. Осенью 1889 года его пригласил преподобный Уильям Дэвидсон — основатель движения за
образование взрослых в США «Шатокуа», который хотел использовать «Великую криптограмму» как
учебное пособие. Далее в 1891 году Доннелли пригласили провести серию дебатов о шекспировском
вопросе с профессором Фриманом из Висконсина. Гонорар должен был составлять 100 долларов за
выступление, столько раз, сколько получится собрать аудиторию. Однако сами дебаты оказались
«развлечением для школьниц», во время которых Доннелли чувствовал себя «Фальстафом». Всё это,
однако, не поколебало уверенности Игнатиуса в том, что он произвёл переворот в шекспироведении, и
однажды в дневнике он с досадой записал, что «величайшей глупостью является заниматься политикой
в то время, когда надо дешифровать до конца код Бэкона»[52].
Параллельно всему перечисленному, Игнатиус Доннелли продолжал активное сотрудничество с
миннесотскими рабочими и фермерскими организациями. При разработке программы Альянса
фермеров в 1886 году, Доннелли советовал включить в документ положения о налоговых
тарифах, биметаллизме, национализации железных дорог и основании агротехнических и
селекционных станций, финансируемых из федерального бюджета. В следующем году был образован
союз рабочих и фермеров в ходе объединения «Миннесотских рыцарей труда» и демократов, который
без предварительного согласия выдвинул Игнатиуса в Палату представителей штата, и он прошёл с
перевесом в 800 голосов. Как представитель альянса, Доннелли отличался большой активностью, но
без всякого успеха. Это проявилось во время обсуждения законопроекта о едином налоге «в духе Генри
Джорджа», против которого активно выступал Игнатиус. Далее он прервал участие в сессиях и вернулся
к шекспировскому вопросу. Осенью 1888 года Доннелли был выдвинут от фермерского альянса на пост
губернатора штата, тогда же объявив, что его долг — «защищать людей от грабежа железнодорожными
корпорациями», но, здраво оценив свои перспективы, 11 октября снял свою кандидатуру. Позднее он
перешёл в стан Демократической партии, и проиграл 150-ю голосами, после чего практически сразу же
включившись в борьбу за кресло федерального сенатора. На следующий день после поражения (19
января 1889 года) он стал писать роман «Колонна Цезаря» [53].