Академический Документы
Профессиональный Документы
Культура Документы
Оглавление
1. Введение в молекулярную иммунологию. Принципы иммунологического
распознавания. ....................................................................................................................................................................... 5
1.1. Фазы иммунного ответа и их характерная длительность ............................................................ 5
1.2. Основные функции иммунной системы. ................................................................................................. 6
1.3. Основные клеточные компоненты иммунной системы................................................................. 7
1.4. Основные гуморальные компоненты иммунной системы. .......................................................... 9
1.5. Какие антибактериальные компоненты иммунной системы считали самыми
важными сторонники клеточной и гуморальной теорий иммунитета? ...........................................10
1.6. Принцип действия профилактических вакцин. Примеры инфекций, против которых
существуют эффективные вакцины. .....................................................................................................................10
1.7. Основные принципы иммунологического распознавания. ........................................................11
1.8. Свойства врожденного иммунитета (по Ч. Джэйнуэю). ................................................................12
2. Врожденный иммунитет. Защита границ............................................................................................12
2.1. Кишечник человека: размер, устройство и факторы защиты от бактерий. ......................12
2.2. Факторы защиты от патогенов на коже ................................................................................................16
2.3. Факторы защиты от патогенов в легких...............................................................................................16
2.4. Защитные реакции клеток эпителия. .....................................................................................................17
2.5. Типы реакции фагоцитов на контакт с инфекцией и на сигналы опасности...................23
2.6. Механизмы хемотаксиса. Природа хемоаттрактантов. Какие клетки и когда
вырабатывают хемоаттрактанты? Приведите как минимум два примера. ....................................24
2.7. Типы клеток, способные к эффективному фагоцитозу. Где, в каких тканях и органах
располагаются фагоциты? ...........................................................................................................................................26
2.8. Основные семейства рецепторов, позволяющие фагоцитам распознавать
молекулярные признаки микроорганизмов. ....................................................................................................28
2.9. Активация фагоцита (в чем она состоит, чем индуцируется). ..................................................29
4. Система комплемента........................................................................................................................................57
4.1. Основные функциональные блоки системы комплемента. .......................................................57
4.2. Какие клетки производят факторы комплемента? ........................................................................59
4.3. Особенности С3 как ключевого фактора системы комплемента. ...........................................60
4.4. Малые белки комплемента и их функции ............................................................................................68
4.5. Альтернативный путь активации комплемента. .............................................................................69
4.6. Классический и лектиновый пути активации комплемента. ....................................................69
4.7. Состав и структура литического комплекса комплемента. ........................................................73
4.8. Защитные функции комплемента. ...........................................................................................................76
4.9. Факторы, защищающие собственные клетки от системы комплемента. ..........................77
4.10. Механизм действия токсина кобры. ...................................................................................................80
5. Рецепторы врожденного иммунитета. Цитокины. Молекулярные механизмы
передачи сигналов. ............................................................................................................................................................81
5.1. Какой рецептор отвечает за распознавание липополисахарида в клеточной стенке
грам-негативных бактерий? Как происходит это распознавание? ......................................................81
5.2. Какой белок в составе бактериальных жгутиков распознается иммунной системой?
Какой рецептор участвует в его распознавании? ...........................................................................................84
5.3. Эндосомальные Toll-подобные рецепторы и их лиганды. ..........................................................85
5.4. Что такое цитокины и на основании чего их классифицируют? Приведите примеры.
86
5.5. В чем особенность рецепторов хемокинов по сравнению с другими цитокинами? .....87
5.6. Что общего между семействами Toll рецепторов и рецепторов ИЛ1/18? ..........................87
5.7. Какое биохимическое событие непосредственно предшествует транслокации NF-kB
в ядро клетки? ....................................................................................................................................................................88
5.8. Из каких компонентов состоят, чем активируются и какие события запускаю
инфламмасомы? ................................................................................................................................................................88
5.10. На примере любых семейств цитокинов проиллюстрируйте и объясните основные
принципы внутриклеточной передачи сигнала. ............................................................................................94
6. Адаптивный иммунитет. Лимфоциты................................................................................................. 101
6.1. Первичные и вторичные лимфоидные органы млекопитающих. ....................................... 104
6.2. Основные направления дифференцировки кроветворных клеток. ................................... 105
6.3. Какие типы Т-клеток помогают В-клеткам в ответе на тимус-зависимые антигены? В
чем заключается эта помощь? ................................................................................................................................ 105
6.4. Какой тип Т-клеток и с участием каких молекул помогает макрофагам? В чем
заключается эта помощь? ......................................................................................................................................... 106
6.5. Теория клональной селекции лимфоцитов...................................................................................... 107
6.6. Строение В-клеточных рецепторов и антител. .............................................................................. 108
6.7. Участие антител в иммунной защите .................................................................................................. 112
6.8. Свойства и функции IgM .............................................................................................................................. 114
6.9. Свойства и функции IgG ............................................................................................................................... 114
6.10. Свойства и функции IgA и IgE .............................................................................................................. 115
6.11. Неонатальный Fc рецептор .................................................................................................................. 116
6.12. Строение Т-клеточного рецептора. .................................................................................................. 116
6.13. Особенности строения и функционирования молекул MHCI и MHCII. ......................... 118
6.15. Генетика и механизм V(D)J рекомбинации. ................................................................................. 122
6.16. Где происходит соматический гипермутагенез, какие клетки в этом участвуют?128
6.17. Зачем нужны гибридомы и что требуется для их получения? ......................................... 131
6.18. В чем отличие ELISPOT от ELISA? ...................................................................................................... 132
6.19. Мешают ли разные антитела друг другу при одновременном анализе на несколько
маркеров методом проточной цитофлуориметрии? ................................................................................. 133
6.20. Какие природные белки применяют для иммунопреципитации, и почему именно
эти? 133
7. Активация лимфоцитов. Развитие лимфоцитов в первичных лимфоидных
органах. ................................................................................................................................................................................... 135
7.1. Сигнальные белки, входящие в комплексы BCR и TCR, и механизм запуска
внутриклеточных сигнальных каскадов. ......................................................................................................... 136
7.2. Основные физиологические последствия активации TCR. ..................................................... 141
7.3. Три типа сигналов, которые Т-лимфоцит получает от активированной антиген-
презентирующей клетки. Что это за клетка, и где происходит взаимодействие?.................... 142
7.4. Основные функции интерлейкина-2 в физиологии Т-клеток. .............................................. 143
7.5. В чем сходство и в чем разница между ITAM и ITIM мотивами? ........................................... 143
7.6. Механизмы активации естественных киллеров............................................................................ 144
7.7. Логика селекции лимфоцитов в первичных лимфоидных органах.................................... 145
7.8. Клеточные и гуморальные особенности первичного и вторичного иммунного ответа.
148
7.9. По каким двум поверхностным маркерам определяют самые многочисленные
клетки в тимусе и в чем биологический смысл этого фенотипа? ...................................................... 148
7.10. В какой анатомической структуре происходит клональная селекция Т-
лимфоцитов? Каков ее алгоритм и основные этапы? ............................................................................... 149
7.11. К каким последствиям для иммунологической толерантности приводят мутации
генов Aire и Fas, и почему. ......................................................................................................................................... 154
8. Дифференцировка лимфоцитов. Иммунологическая толерантность и онтогенез
иммунной системы. ........................................................................................................................................................ 155
8.1. Основные субпопуляции Т-хелперов: характеристические цитокины и функции. ... 155
8.2. Какие клетки обозначают аббревиатурой ILC? Взаимосвязь между типами ILC и
типами Т-хелперов........................................................................................................................................................ 156
8.3. Иммунологический синапс - устройство и биологическая роль. ......................................... 157
8.4. Последовательность событий при уничтожении клетки-мишени Т-киллером. ......... 158
8.5. Типы эффекторных Т-клеток и их характеристические цитокины (по 1-2 для
каждого типа). ................................................................................................................................................................. 159
8.6. Механизм действия циклоспорина А. Примеры иммуносупрессантов, действующих
на внутриклеточные и мембранные белки-мишени. ................................................................................ 162
8.8. Механизмы действия Т-регуляторных клеток. .............................................................................. 162
8.9. Функции вторичных лимфоидных органов. .................................................................................... 163
8.7. Функции и последствия мутаций гена FoxP3. ................................................................................. 163
8.10. Иммунопривилегированные органы. Последствия нарушения целостности
гематоэнцефалического барьера. ......................................................................................................................... 164
8.11. Группы крови системы AB0 как пример центральной толерантности........................ 166
8.12. Механизмы поддержания иммунологической толерантности в здоровом
кишечнике. ........................................................................................................................................................................ 167
8.13. Правила отторжения трансплантатов между инбредными линиями мышей. ........ 168
8.14. Прямое и непрямое аллогенное распознавание. ...................................................................... 168
8.15. Механизмы поддержания иммунологической толерантности при беременности.
Резус-конфликт............................................................................................................................................................... 169
8.16. Особенности иммунной системы новорожденных. ................................................................ 170
8.17. Изменение клональной структуры периферических Т-лимфоцитов с возрастом.171
9. Иммунная система и рак. Аутоиммунные заболевания. Аллергические реакции.
172
9.1. Хроническое воспаление и рак. ............................................................................................................... 173
9.2. Использование активации врожденного иммунитета в иммунотерапии рака............ 175
9.3. Опухоли вирусного происхождения и гипотеза иммунного надзора. ............................... 177
9.4. Вакцинация против онкогенных вирусов. Механизм действия профилактических
вакцин. ................................................................................................................................................................................. 181
9.5. ВПЧ и рак шейки матки ............................................................................................................................... 182
9.6. Противораковые вакцины на основе дендритных клеток. ..................................................... 183
9.7. Иммуноредактирование злокачественных опухолей. ............................................................... 184
9.8. Способы генетической модификации Т-лимфоцитов для клеточной терапии рака.184
9.9. CAR-T технология ............................................................................................................................................ 185
9.10. Способы использования антител для иммунотерапии рака.............................................. 187
9.11. Механизм действия CTLA-4 и PD-1. .................................................................................................. 190
9.12. Блокировка "иммунологических чекпойнтов" в иммунотерапии рака. ...................... 192
9.13. Побочные эффекты иммунотерапии рака. ................................................................................... 194
9.14. Аутоиммунные заболевания и инфекции .................................................................................... 195
9.15. Аллергические заболевания и микробиота................................................................................. 197
9.16. Способы подавления аллергических реакций. .......................................................................... 199
10. Иммунодефициты. Обратная генетика в иммунологии. Иммунологические
аспекты COVID-19 и ВИЧ/СПИД. ............................................................................................................................. 200
10.1. Особенности первичных и вторичных иммунодефицитов................................................. 200
10.2. Примеры и основные клинические проявления первичных иммунодефицитов. . 201
10.3. Примеры мутаций, приводящих к SCID. ......................................................................................... 202
10.4. Примеры мутаций, приводящих к X-SCID. .................................................................................... 202
10.5. В передаче сигналов от каких рецепторов участвует общая гамма-цепь и к каким
последствиям приводит ее мутация? ................................................................................................................. 203
10.6. В чем биологическая роль молекулы CD40, и почему ее мутация приводит к гипер-
IgM синдрому? ................................................................................................................................................................. 204
10.7. Мутация каких молекул приводит к аутоиммунному лимфопролиферативному
синдрому, и почему?..................................................................................................................................................... 205
10.8. Использование систем репарации ДНК для генетического нокаута и для точного
редактирования генома. ............................................................................................................................................ 205
10.9. Каким способом блокируют TNF и для чего это нужно. ....................................................... 210
10.10. Что такое тоцилизумаб и почему он помогает при COVID-19. .......................................... 211
10.11. Какой белок коронавируса является наиболее перспективной мишенью при
разработке вакцин, и почему. ................................................................................................................................. 217
10.12. Какие терапевтические мишени используются при высокоэффективной анти-
ретровирусной терапии при лечении ВИЧ/СПИД? ..................................................................................... 217
10.13. Назовите известные вам свойства ВИЧ-1, которые осложняют борьбу с ним. ........ 221
10.14. Основные факторы иммунодефицита при СПИД. .................................................................... 221
1. Введение в молекулярную иммунологию. Принципы
иммунологического распознавания.
5-10 слоев клеток. 100 мкм. Роговой, гранулярный, шиповатый базальный слои.
Роговой слой гидрофобен, в него секретируются дефензины и каталецидины
(антимикробная активность).
120-140 м2. 700 000 000 альвеол диаметром 300 мкм. Однослойный эпителий.
Реснички создают ток жидкости, выводящий патогены наружу. Альвеолоциты 2 типа
секретируют дефензины помимо сурфактанта.
2.4. Защитные реакции клеток эпителия.
Рецепторы к дц и оц РНК, СрG-островкам, отсутствующим у прокариот.
2.5. Типы реакции фагоцитов на контакт с инфекцией и на сигналы
опасности.
2.6. Механизмы хемотаксиса. Природа хемоаттрактантов. Какие
клетки и когда вырабатывают хемоаттрактанты? Приведите как
минимум два примера.
Кишечник и
макрофаги
кишечные Пейеровы бляшки
TIR-домен во внутренней части рецептора (этот домен есть в TLRs). Сигнальный каскад,
как у TLRs.
IL-10 противовоспалительный.
Семейство TNF – защита от инфекций, индукция апоптоза (FasL).
Красным отмечены штормящие цитокины.
5.5. В чем особенность рецепторов хемокинов по сравнению с
другими цитокинами?
Белки А и G золотистого
стафилококка прочно взаимодействуют с Fc-фрагментом антител, что позволяет
использовать их для выделения и очистки иммунных комплексов.
Сшивка генома формальдегидом. Дробление ультразвуком. Оценка представленности
фрагментов в геноме.
7. Активация лимфоцитов. Развитие лимфоцитов в первичных
лимфоидных органах.
7.1. Сигнальные белки, входящие в комплексы BCR и TCR, и
механизм запуска внутриклеточных сигнальных каскадов.
У BCR нет внутриклеточных доменов. Они передают сигнал посредством Ig-альфа и бета.
Кальциневрин – фосфатаза.
Слабая сила TCR сигнала – развитие в направлении наивных Т-хэлперов, более сильное –
Т-рэгов. Позитивная селекция в кортикальной зоне, негативная в медуллярной.
Без трп не могут делиться. Конкуренция за IL-2 ингибирует положительную обратную связь
с АПК.
8.9. Функции вторичных лимфоидных органов.
The secondary (or peripheral) lymphoid organs (SLO), which include lymph nodes and the spleen,
maintain mature naive lymphocytes and initiate an adaptive immune response. The peripheral
lymphoid organs are the sites of lymphocyte activation by antigens. Activation leads to clonal
expansion and affinity maturation. Mature lymphocytes recirculate between the blood and the
peripheral lymphoid organs until they encounter their specific antigen.
https://en.wikipedia.org/wiki/Lymphatic_system#Secondary_lymphoid_organs