МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ УКРАИНЫ

Украинская медицинская стоматологическая академия

Кафедра биохимии
Непорада К.С.

МАТРИЧНЫЕ БИОСИНТЕЗЫ
 План лекции

• Репликация
• Транскрипция
• Трансляция
 Матричные биосинтезы
• Репликация – биосинтез ДНК. Субстратами
являются дезоксирибонуклеозид-5′-
трифосфаты.
• Транскрипция - процесс переноса
генетической информации с ДНК на РНК.
Биосинтез всех видов РНК - мРНК, рРНК и
тРНК – происходит соответственно
последовательности нуклеотидов в ДНК,
являющейся матрицей. Субстратами
выступают рибонуклеозид-5′-трифосфаты.
• Трансляция - процесс декодирования мРНК,
в результате которого информация с языка
последовательности нуклеотидов мРНК
переводится на язык аминокислотной
последовательности белка. Происходит
трансляция на рибосомах, субстратами
выступают аминокислоты (аминоацил-тРНК).
• Главными матричными процессами,
присущими всем живым организмам,
являются репликация ДНК,
транскрипция и трансляция.
• Каждый имеет 3 стадии:
Инициация – начало биосинтеза
биополимера.
Элонгация – удлинение цепи
(полимеризация мономеров)
Терминация – окончание биосинтеза
биополимера.
 РЕПЛИКАЦИЯ ДНК
• Репликация – это биосинтез ДНК,
который происходит в S-фазу
клеточного цикла и отвечает за полное
копирование генетической
информации для передачи ее при
делении клетки.
• Эукариотическая хромосома является
полирепликоном – она содержит
большое количество точек инициации:
в целом, геном содержит около 40 тыс.
точек инициации – ориджинов, что
обеспечивает репликацию ДНК за 9
часов.
Субстраты репликации –
дезоксирибонуклеизид-5′-трифосфаты
(дАТФ, дГТФ, дЦТФ, дТТФ) как
макроэргические соединения. Именно
при отщеплении пирофосфата во время
полимеризации нуклеотидов с
образованием 3′-5 ′-фосфодиэфирной
связи освобождается энергия, которая
обеспечивает процесс биосинтеза ДНК.
Для репликации используется более 20
типов ферментов и белков. Весь
комплекс називають ДНК-репликазной
системой или реплисомой.
 Ориджины (origin, англ. «начало»)
Репликация инициируется синхронно
на соседних 25-100 репликонах, которые
составляют так называемую репликативную
фабрику. При этом разные участки хроматина
реплицируются не одновременно: в
последнюю очередь происходит репликация
гетерохроматиновых зон.

Репликация ДНК начинается с

небольшого участка - ориджина (origin), где
осуществляется инициация процесса, главным
моментом которой является расхождение цепей
ДНК. Дальше по ходу репликации такой
репликативный пузырь разрастается в двух
противоположных направлениях. На каждой
стороне пузыря существует так называемая
репликативная вилка, в основании которой и
происходит синтез ДНК. Участок ДНК, где
осуществляется репликация, начинающаяся из
одной точки, называют репликоном.
 ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ ДНК
Стадию инициации обеспечивают ДНК-полимераза способна выполнять только
ферменты: ДНК-топоизомеразы, ДНК-хеликаза, одну операцию - удлинять (редактируя) 3'-конец цепи
праймаза ДНК, она не может инициировать синтез, создавать
первую фосфодиэфирную связь поэтому для начала
Ферменты ДНК-топоизомеразы имеют
синтеза ДНК необходима затравка - праймер. Роль
нуклеазную активность и регулируют
праймера выполняет нитка РНК (10-60 нуклеотидов).
суперспирализацию ДНК.
Она синтезируется комплементарно определенному
ДНК-топоизомеразы Іb (только участку ДНК при участии праймазы (ДНК-зависимой
эукариотические) переводят любую ДНК в РНК-полимеразой).
максимально релаксированное состояние.
Ферменты хеликазы (лат. helix — спираль)
Механизм их действия: мультидоменный
расплетают короткие участки ДНК, которые находятся
мономерный белок связывается с ДНК, окружая
непосредственно перед репликативной вилкой. Для
двойную спираль со всех сторон; осуществляется
разделения каждой пары оснований используется
одноцепочечный разрыв; один из концов, которые
энергия гидролиза двух молекул АТФ. В результате
образовались, получает способность свободно
этого происходит раскручивание участка
поворачиваться вокруг интактной цепи; после 3-4
суперспирализированной молекулы ДНК. В
случайных поворотов разрыв сшивается и фермент
поддержании этого участка ДНК в раскрученном
диссоциирует. Поскольку повороты являются
состоянии принимают участие SSB-белки (англ. single
свободными, они осуществляются в направлении
strand binding proteins), которые связывают
снижения напряжения - максимальной
одноцепочечные нити ДНК, противодействуя их
релаксации.
повторному объединению.
 ЭЛОНГАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ ДНК
https://ru.wikipedia.org/wiki/
Скорость репликации - 100 нуклеотидов в секунду, частота
ошибок не превышает 1 на 109–1010 нуклеотидов.
После раскручивания двойной спирали ДНК образуются
две одноцепочечные матрицы, одна цепь при этом имеет
направление 3′→5′, а вторая — 5′→3′ (поскольку в двухцепочечной
молекуле ДНК цепи антипараллельные). Субстратами и источниками
энергии для синтеза новой цепи служат 4 дезоксирибонуклеозид-5′-
трифосфаты — дАТФ, дГТФ, дЦТФ и дТТФ.
Синтез новых цепей (элонгация) происходит только в
направлении 5′→3′, антипараллельно к матричной цепи.
Направление одной цепи совпадает с направлением движения
репликативной вилки (лидирующая цепь), а на другой будет
проходить в противоположном направлении (отстающая цепь).
Поэтому ведущая цепь синтезируется непосредственно в
направлении движения репликативной вилки, а отстающая —
прерывисто с образованием фрагментов (100 нуклеотидов), которые
потом сшиваются. Эти фрагменты получили название фрагментов
Оказаки (по фамилии ученого, который их открыл в 1968 г.). Синтез
фрагментов Оказаки также начинается с праймеров, которые после
завершения синтеза фрагментов удаляются. Затем фрагменты
Оказаки соединяются друг с другом при помощи фермента ДНК-
лигазы. Две новые цепи, соединенные со своими
комплементарными цепями, образуют две дочерние двойные
спирали, каждая из которых содержит одну материнскую и одну
вновь синтезированную цепь (полуконсервативный способ).
 Типы ДНК-полимераз
В синтезе эукариотических ДНК принимают
участие 5 типов ДНК-полимераз — α, β, γ, δ, ε.
ДНК-полимеразы — α, δ, ε принимают участие в
репликации ядерного хроматина.
ДНК-полимераза — β принимает участие в
репарации ДНК.
ДНК-полимераза — γ реплицирует
митохондриальную ДНК.
Эти ферменты, независимо от типа клеток, в
которых происходит репликация, присоединяют
нуклеотид к ОН-группе на 3‘-конце праймера
цепи, которая растет в направлении 5' → 3'.
Поэтому они обладают 5'→ 3' полимеразной
активностью. Кроме этого, способны
коррегировать ошибки, вырезая нуклеотиды в
направлении 3 '→ 5, то есть обладают 3' → 5'-
экзонуклеазной активностью. Северин С.Е. Биологическая химия с упражнениями и задачами: учебник / под ред. чл.-
корр. РАМН С.Е. Северина. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2011. – С.120.
 Теломеры и теломеразы
Особенность эукариотической хромосомы состоит в том, что
она, в отличие от прокариотической, является линейной -
имеет два конца. В результате этого простого обстоятельства
на 3'-концах матричных цепей ДНК остаются
одноцепочечные хвосты: два РНК-праймера на 5'-концах
синтезированных цепей удаляются, а брешь не может быть
заполненной, поскольку нет 3'-конца, который мог бы быть
использован как праймер. Одноцепочечные хвосты
подвергаются быстрому нуклеазному гидролизу и после
каждой репликации хромосома должна укоротиться.
https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Telomere.png
Конечные участки ДНК эукариотической
хромосомы - теломеры – состоят из небольших
элементов – тандемно повторяющихся
последовательностей - теломерных повторов (TTAGGG)n.
Удлинение теломеров после репликации осуществляется
при помощи специального фермента - теломеразы,
которая является РНК-зависимой ДНК-полимеразой,
предотвращает потерю ДНК при каждой репликации.
Теломераза активна в развивающихся и
злокачественно трансформованных клетках, а неактивна
- в дифференцированных соматических клетках высших
эукариот. Соответственно, определенное критическое
сокращение теломеров, которое происходит в таких
клетках после нескольких десятков клеточных делений,
есть одним из механизмов активации программы их
гибели.
Однако, соматические клетки практически
лишены активности теломеразы, что делает возможным
осуществить только 50-70 циклов деления, после чего
клетки погибают. Этот феномен называется лимитом
Хейфлика.
 Теломеры и теломеразы
• Концы линейных хромосом с 3′-конца ДНК оканчиваются Длина теломерного участка сильно варьирует в
повторяющимися последовательностями нуклеотидов -
теломерами, которые синтезируются ферментом теломеразой. зависимости от вида организма, типа клеток и
• Структуры теломер одинаковы у всех позвоночных - (TTAGGG) n. количества раундов репликации, которую прошла
• Сокращение теломер - ключевой фактор, который запускает ДНК. В среднем, она составляет 10-15 тыс. пар
развитие дегенеративных заболеваний и снижает оснований у человека и может достигать до 100
продолжительность жизни.
тыс. пар оснований у некоторых видов грызунов.
• Длина теломер является прогностическим показателем риска
заболеваний, их прогрессирования и преждевременной
смертности, а также характеристикой снижения выживаемости у
пациентов с ишемической болезнью сердца и инфекционными
заболеваниями.
• Измерение активности теломеразы может обеспечить более
ранний прогноз геномной стабильности долгосрочной
жизнедеятельности, чем длина теломер.
• Оценка разных аспектов состояния теломер может помочь в
прогнозировании течения разных заболеваний и предоставлять
новые возможности для профилактических и терапевтических
мероприятий, в том числе временной активации эндогенной
теломеразы.
https://health-ua.com/article/36081-sistema-telomerytelomeraza-kak-
molekulyarnogeneticheskij-indikator-stareniy
 ТРАНСКРИПЦИЯ
Транскрипция — процесс синтеза РНК
с использованием ДНК как матрицы,
другими словами, это перенос
генетической информации с ДНК на
РНК.
Синтез молекул РНК начинается в
определенных последовательностях
(сайтах) ДНК — промоторах и
заканчивается в терминирующих
участках (сайтах терминации). Участок
ДНК, ограниченный промотором и
сайтом терминации, представляет
собой единицу транскрипции — https://uk.wikipedia.org/
транскриптон.
 ТРАНСКРИПЦИЯ
На первой стадии происходит связывание
РНК-полимеразы с промотором ДНК-
матрицы. Взаимодействие РНК-полимеразы с
промотором облегчает ТАТА-фактор, который
взаимодействует со специфической
последовательностью нуклеотидов
промотора — ТАТААА-(ТАТА-бокс).
Синтез молекулы РНК происходит в
направлении 5′→3′ антипараллельно
матричной цепи ДНК. В процессе элонгации
(удлинение полинуклеотидной цепи) РНК-
полимераза передвигается вдоль матрицы
ДНК и комплементарно ей последовательно
присоединяет нуклеотиды с помощью
фосфодиэфирных связей с образованием
растущей цепи РНК.
 ТРАНСКРИПЦИЯ. ТИПЫ РНК-ПОЛИМЕРАЗ
Субстратами транскрипции являются
рибонуклеозид-5′-трифосфаты (АТФ,
ГТФ, ЦТФ, УТФ).
Общая схема РНК-полимеразной
реакции
n1АТФ + n2ГТФ + n3ЦТФ + n4УТФ → РНК
+ (n1 + n2 + n3 + n4)Н4Р2О7.
Для транскрипции не нужен
праймер.
У эукариот для транскрипции
используются три ДНК-зависимых
РНК-полимеразы. РНК-полимераза I
локализована в ядрышке, где она
катализирует синтез рРНК в виде
большого первичного транскрипта
(45S пре-рРНК), который содержит
молекулы рРНК 18S, 5,8S и 28S. РНК-
полимераза II находится в
нуклеоплазме и принимает участие в
синтезе первичного транскрипта пре-
мРНК (гяРНК). РНК-полимераза III
также локализована в нуклеоплазме
и принимает участие в синтезе тРНК и
5S-pPHK.
 Транскрипция
Терминация транскрипции
наступает после достижения РНК-
полимеразой сайтов терминации
(стоп-сигнала). Первичные
транскрипты РНК или пре-РНК,
которые синтезировались,
являются комплементарными
копиями транскриптонов ДНК и
содержат как информативные
(экзоны), так и неинформативные
(интроны) участки. Молекулы пре-
РНК подвергаются дальше
посттранскрипционному
процессингу.
 Посттранскрипционный процессинг
Созревание пре-мРНК с
образованием функциональной матрицы
называют процессингом (processing).
Он состоит из трех операций:
• Кэпирование - модификация 5'-конца с
образованием так называемого кэпа (cap).
• Сплайсинг (splicing) - вырезание интронов и
сшивание экзонов - процесс, в результате
которого мРНК становится копией только
кодирующей части гена или ее фрагментов:
сплайсинг часто может происходить
несколькими альтернативными путями
(альтернативный сплайсинг).
• Полиаденилирование - присоединение к 3'-
концу polyА последовательности, что тесно
связано с терминацией транскрипции.
Альтернативный сплайсинг - вариант
сплайсинга матричных РНК (мРНК), при
котором в ходе экспрессии гена на основании
одного и того же первичного транскрипта
(пре-мРНК) происходит образование
нескольких зрелых мРНК, соответственно,
разных белков.
Альтернативный сплайсинг считается
основным процессом, который приводит к
полиморфизму белков, которые значительно
превышают количество генов в геноме.
Так, например, в геноме человека
находится меньше 19 тысяч функциональных
генов. В то же время, количество известных
белков человека, по базе данных UniProt,
превышает 154 тысячи (UniProtKB results: Homo
sapiens ).
 Посттранскрипционный процессинг
Функциональное значение кэпа:
• Защита 5'-конца от деградации:
особенность связи между первыми двумя
нуклеотидами делает эту связь незаметной
для экзонуклеаз.
• Участие в других реакциях процессинга:
стимулирует сплайсинг первого интрона и
полиаденилирование 3'-конца.
• Транспорт мРНК в цитоплазму совершается
благодаря взаимодействию с ядерной порой:
именно своим 5'-концом мРНК
выталкивается в цитоплазматическое
пространство.
• Инициация трансляции: именно кэп Строение 5'-конца кэпированной мРНК
является первичной точкой сборки рибосомы
и других элементов инициации белкового https://uk.wikipedia.org/
синтеза.
 ГЕН
Согласно определению Международного
консорциума онтологии последовательностей
(Sequence Ontology Consortium), ген - это
«определенная зона последовательности ДНК,
которая соответствует единице наследственности
и ассоциирована с регуляторными участками,
участками, которые транскрибируются, и/или
другими функциональными участками
последовательности».
Все гены многоклеточного организма можно
разделить на две группы:
1) гены, от которых зависят определенные
универсальные функции и которые активны
во всех клетках, - «гены домашнего
хозяйства» (housekeeping genes);
2) гены, которые специфично активируются в
клетках определенного типа.
Одним из самых важных типов продуктов
транскрипции генов являются мРНК - матричные
РНК, которые используются дальше как матрицы
для синтеза белков. Кроме того, достаточно
большое количество генов кодирует
разнообразные молекулы РНК, которые не
поддаются трансляции (являются конечными
продуктами): рРНК - рибосомальные РНК; тРНК -
транспортные РНК; микро-РНК и др. типы РНК.
С точки зрения биологической химии, ген
– это участок ДНК, в котором закодирована
аминокислотная последовательность одной
полипептидной цепи или структура тРНК, рРНК.
 Современное состояние теории гена
• Ген - участок молекулы ДНК, который имеет определенную • Действие гена строго специфично, так как ген может кодировать только одну
последовательность нуклеотидов. Представляет собой сложную аминокислотную последовательность и регулирует синтез только одного
функциональную единицу наследственной информации, которая состоит из конкретного полипептида.
разных функциональных сегментов.
• Некоторые гены имеют плейотропное действие, определяя развитие сразу
• Разные гены имеют разный качественный и количественный состав нескольких признаков. Например, синдром Марфана.
нуклеотидов.
• Дозирование действия гена состоит в зависимости интенсивности
• Каждый ген имеет определенное место (локус) в хромосоме. проявления признака (экспрессивность) от количества определенного
аллеля. Например, много заболеваний в гетерозиготном состоянии
• Гены способны к рекомбинации (в процессе кроссинговера) и мутации, что проявляются слабее, чем в гомозиготном.
обеспечивает изменчивость.
• На активность гена могут влиять как внутренняя, так и внешняя среда.
• В хромосоме есть гены мРНК (структурные гены), гены рРНК и гены тРНК.
• Конститутивные гены - это гены, которые постоянно экспрессируются, так
• Среди структурных генов есть регуляторные гены, продукты которых как белки, которые они кодируют, необходимы для постоянной клеточной
регулируют работу других структурных генов. деятельности, обеспечивают синтез белков «домашнего хозяйства» - белки
• Ген непосредственно не принимает участие в синтезе белков, он является рибосом, цитохромов, ферментов гликолиза, переносчиков ионов и др. Эти
«матрицей» для посредников - разных молекул РНК, которые гены не требуют специальной регуляции.
непосредственно принимают участие в синтезе белков. • Неконститутивные гены - эти гены обычно неактивные, но экспрессируются
• Количество генов может удваиваться в процессе репликации, а потом только тогда, когда белок, который они кодируют, нужен клетке. Эти гены
распределяться в дочерние клетки в результате митоза или мейоза. регулируются. Эти белки обеспечивают дифференцировку, специфичность
структуры и функции каждой клетки.
• Ген может существовать в виде разных аллелей, которые определяют
варианты признаков. • Молекулы ДНК способны к репарации, поэтому не всякие повреждения гена
ведут к мутациям.
• Определенный структурный ген кодирует синтез одного полипептида.
Отдельный белок может обусловливать определенный признак. Этим • Генотип, будучи дискретным (состоящим из отдельных генов)
обусловлены моногенные признаки. функционирует як единое целое.
В.И. Павличенко, А.В. Абрамов Основы молекулярной биологии и генетики. Учебное пособие
• Клетка, орган или организм обладают многими сложными признаками, для студентов медицинских вузов. – Запорожье, 2007. – 293с
которые складываются при взаимодействии многих генов – это полигенные
признаки.
 Компоненты белоксинтезирующей системы
клеток
• Ген
• мРНК
• Рибосомы (рРНК)
• тРНК
• Аминокислоты
• Аминоацил-тРНК-синтетазы
• АТФ, ГТФ, Мg
• Белковые факторы инициации,
элонгации, терминации LadyofHats - File:Ribosome mRNA translation en.svg
ТРАНСЛЯЦИЯ. ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД
Уникальность разнообразных
клеток обусловлена ​уникальностью
их белков.
Генетический код – это
декодирование нуклеотидной
последовательности нуклеиновых
кислот в аминокислотную
последовательность белка.
В ДНК есть 4 типа нуклеотидов, а в
белках-20 аминокислотных остатков:
дуплетний код - 4 • 4 = 16 кодонов, а
триплетный образует 4 • 4 • 4 = 64
разных кодонов.
 СВОЙСТВА ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА
Генетический код имеет такие фундаментальные
характеристики:
• Триплетность. Три нуклеотида, кодон, кодируют одну
аминокислоту.
• Специфичность. Каждый отдельный триплет кодирует
только одну определенную аминокислоту.
• Непрерывность - отсутствие разделительных знаков.
Генетический код не имеет «знаков пунктуации» между
кодонами в структурных генах.
• Универсальность. Кодон в ДНК или мРНК определяет
одну и ту же аминокислоту в белке всех организмов от
вируса до человека.
• Вырожденность. Одна аминокислота часто имеет более
чем один кодон.
• Коллинеарность. ДНК - линейная полинуклеотидная цепь,
а белок - линейная полипептидная. Последовательность
аминокислот в белке соответствует последовательности
триплетов в его гене (у прокариот).
• Однонаправленность - процесс считывания информации
генетического кода с матричной цепи молекулы ДНК идет
только в одном направлении - от 5'- конца до 3'-конца.
 Активация аминокислот и образование
аа-тРНК
Процесс присоединения
аминокислот к тРНК катализируется
аминоацил-тРНК-синтетазами.
Каждая из 20 типов этих ферментов
катализирует две реакции:
• На первой стадии происходит
активация аминокислоты - ее
присоединение к АМФ с
образованием
аминоациладенилата.
• Аминоациладенилат образует
промежуточный комплекс с
активным центром фермента и
эффективно атакует ОН-группу
рибозы 3'-концевого аденозина
тРНК: происходит перенос
аминокислоты на тРНК (аа-тРНК).
Аа-тРНК - макроэргическое
соединение: разрыв связи между
аминокислотой и тРНК является
энергетически выгодным, что и
обеспечивает образование Общее строение аминоацил-тРНК
пептидной связи на рибосоме.
 Инициация трансляции
Суть инициации состоит в:
• распознавании стартового кодона,
который дает начало и рамку
считывания информации;
• сборке рибосомы из двух
субъединиц на мРНК в зоне
стартового кодона;
• загрузке инициирующей аа-тРНК на
стартовый кодон и одновременно в
Р-сайт рибосомы. Стартовым
кодоном выступает метиониновый
кодон AUG, соответственно,
инициирующей всегда есть Met- Северин С.Е. Биологическая химия с упражнениями и задачами: учебник / под ред. чл.-
тРНК и Met. корр. РАМН С.Е. Северина. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2011. – С.137.
 Элонгация трансляции
Цикл начинается с такой конфигурации системы, когда в Р-сайте находится
пептидил-тРНК, А-сайт является свободным от тРНК и в его границах на
малой субъединице расположен очередной кодон, который может быть
узнанным.
Первая операция цикла - связывание аа-тРНК с А-сайтом. Связывание
должно произойти с высокою специфичностью относительно
взаимодействий между кодоном и антикодоном - только
комплементарная данному кодону тРНК должна быть отобрана системой.
Результатом связывания является соответствующее расположение
акцепторных частей аа-тРНК и пептидил-тРНК относительно друг друга и
каталитически активного центра.
В результате рибосома совершает вторую операцию - транспептидацию -
перенос пептидила с пептидил-тРНК на аминокислоту в составе аа-тРНК.
Результатом будет перестройка системы: в А-сайте окажутся пептидил-
тРНК с удлиненным на одну аминокислоту пептидилом, в Р-сайте -
деаминоацилированная тРНК.
Третья операция - транслокация – состоит в перемещении рибосомы на
один кодов вдоль мРНК (молекулы тРНК остаются связанными со своими
кодонами), после чего начинается следующий элонгационный цикл.
Северин С.Е. Биологическая химия с упражнениями и задачами:
учебник / под ред. чл.-корр. РАМН С.Е. Северина. – М.: ГЭОТАР-
Медиа, 2011. – С.138.
 Терминация трансляции
Когда после очередного элонгационного
цикла (который станет последним) в А-сайте
оказывается один из трех стоп-кодонов, он
узнается фактором терминации трансляции RF1
или RF2 (RF - Release Factor) – ни одна тРНК не
содержит соответствующих антикодонов. Этот
фактор рекрутирует к рибосоме комплекс
RF3·GTP. Под действием последнего срабатывает
пептидилтрансферазный центр рибосомы,
пытаясь осуществить перенос пептидила.
Поскольку в А-сайте нет обычного субстрата
транспептидации, происходит перенос на
молекулу воды - гидролиз связи С-концевой
аминокислоты с рибозою в составе пептидил-
тРНК. На этом заканчивается собственно
терминация трансляции - с рибосомы
освобождается полипептид. Рибосома
диссоциирует. Северин С.Е. Биологическая химия с упражнениями и задачами: учебник /
под ред. чл.-корр. РАМН С.Е. Северина. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2011. – С.139
 Фолдинг и посттрансляционный
процессинг
Терминация белкового синтеза на рибосоме не • Образование дисульфидных мостиков -
означает образование функционально активной ковалентных S-S-связей между двумя
молекулы белка. приближенными в пространстве остатками Cys.
Процесс укладывания белка в нативную структуру • Ковалентные посттрансляционные
- это поиск конформации, которая соответствует модификации аминокислотных остатков
минимуму свободной энергии для данной (фосфорилирование (гликогенфосфорилаза),
последовательности аминокислот, и, гидроксилирование (коллаген), ацетилирование
соответственно, является самой стабильной. (гистоны), гликозилирование (антитела,
муцин, ТТГ и т.д.), присоединение
Примеры процессинга: полисахаридов (протеогликаны),
• Частичная протеолитическая деградация простетических групп (гемоглобин, миоглобин)
(ограниченный протеолиз) - отщепление и кофакторов (холоферменты) небелковой
концевых участков цепи, чаще на N-конце, или природы.
иногда разрезание цепи на отдельные
фрагменты. Частичная деградация является
особенно характерной для секреторных белков
и ферментов, которые имеют гидролитическую
активность, - такая деградация переводит белок
в активную форму (пепсиноген, трипсиноген,
ангиотензиноген, кининогены).
 ШАПЕРОНЫ
Фолдинг – образование Более универсальные шапероны
равновесных условий постепенного относятся к семейству HSP - белков
поиска нативной структуры и защита от теплового шока (heat shock proteins).
агрегации – обеспечивается
специальными белками - шаперонами (от
фр. chaperon – сопровождающий).
Шапероны не определяют ни нативную
структуру белка, ни путь его укладывания -
и то, и другое детерминируется
аминокислотной последовательностью.
Главная функция шаперонов – обеспечить
условия для быстрого поиска нативной
конформации, создавая своеобразный
«инкубатор» для неструктурированной
полипептидной цепи.
Предполагаемый механизм взаимодействия белков теплового шока с частично
денатурированными белками (Lindner R.A., Treweek T.M., Carver J.A,. 2001)
 Література
1. Біологічна і біоорганічна хімія: у 2 кн.: підручник. Кн. 1 Біоорганічна хімія / [Зіменковський Б.С.,
Музиченко В.А., Ніженковська І.В. та ін.]; за ред. Б.С. Зіменковського – К.: ВСВ «Медицина», 2014. – 272
с.
2. Біологічна і біоорганічна хімія: у 2 кн.: підручник. Кн. 2 Біологічна хімія / [Губський Ю.І.,
Ніженковська І.В., Корда М.М. та ін.]; за ред. Ю.І. Губського. – К.: ВСВ «Медицина», 2016. – 544 с.
3. Біохімія: підручник / за загальною редакцією професора А.Л. Загайка, проф. К.В. Александрової – Х.:
Вид-во «Форт», 2014. – 728 с.
4. Губський Ю.І. Біологічна хімія / Губський Ю.І. - Київ-Тернопіль, Укрмедкнига, 2000. – 508 с.
5. Сиволоб, А.В. Молекулярна біологія : підручник / А.В. Сиволоб. - К. : Видавничополіграфічний центр
«Київський університет», 2008. - 384 с.
6. Гонський Я.І. Біохімія людини / Гонський Я.І., Максимчук Т.П., Калинський М.І Підручник. Тернопіль:
Укрмедкнига, 2002.- 744 с.
7.Уотсон, Дж. Д. Двойная спираль. Воспоминания об открытии структуры ДНК. - М. : Регулярная и
хаотическая динамика, 2001.
9. International Human Genome Sequencing Consortium. Finishing the euchromatic sequence of the human
genome // Nature. - 2004. - Vol. 431. -Р. 931-945.