Академический Документы
Профессиональный Документы
Культура Документы
me
CpG
GpC
me
CpG островки
CpG
CpG island
met
CpG CpG/GpC ~ 1
CpG/GpC ~ 0,2
house-keeping gene
met
ССGG MspI
GGCC
met
В CpG островках расположено около 60% всех промоторов, в том числе
абсолютное большинство промоторов генов «домашнего хозяйства»
В тех промоторах, которые располагаются в CpG островках, все сайты
связывания транскрипционных факторов расположены в пределах CpG
островка.
На ранних стадиях дробления происходит полное деметилирование генома,
после чего специфический статус метилирования устанавливается de novo
H a e II 9 0 3 Fok I 1553
0 200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 1800 2000
M s p I/H p a II
s i te s
*
Sm a I Sm a I Sm a ISm a I Sm a I
P robe 2 P robe 1
P r o te c te d D N A fr a g m e n t
u C p G fra g m e n t
Селективное метилирование CpG динуклеотидов в
границах uCpG фрагмента подавляет активность
промотора альфа D гена
Pα D C A T gene
uCpG Pα D C A T gene
uCpG Pα D C A T ge ne
m e th yl- C p G
uCpG Pα D C A T ge ne
m e th yl- C p G
0 20 40 60 80 100 %
Что еще инактивируется метилированием ДНК
транспозоны
DNMT-I
HDAC-I
Долгое время считалось, что активные домены в хроматине
создаются в результате действия определенных регуляторных
систем, тогда как пассивное (т.е. препятствующее транскриции)
состояние “задано по умолчанию”
В последние годы стало очевидным, что репрессивные домены
дакже создаются под действием определенных регуляторных
механизмов. Большую роль в осознании этого факта сыграло
изучение феномена мозаичной экспрессии генов
(“variegated expression”, PEV)
PEV связан с упаковкой домена в конститутивный гетерохроматин. Существует
целый ряд мутаций, подавляющих PEV (Suvars). Изучение соответствующих
генов позволило идентифицировать ключевые белковые продукты,
необходимые для поддержания компактной упаковки неактивных доменов.
Важнейшими из них являются гистонметилазы и структурные белки
гетерохроматина (HP1 у человека, Sir белки у дрожжей)
SUV39H1 непосредственно
участвует в привлечении HP1
Метилирование H3/K9 гистонметилазой
G9a подавляет транскрипцию, но без
участия HP1, а посредством стимуляции
деацетилирования гистонов
HP1
Mi2 (AТФазная субъединица комплекса NURF
сочетающего ремоделирующую хроматин и гистон-
деацетилазную активности)
MBD domain – связывание с метилированными CpG динуклеотидами
не связывается с
метCpG
Наиболее хорошо изучен белок MeCp2, способный связываться с одним метилированным
CpG. Этот белок обладает доменом, подавляющим транскрипцию (transcription repression
domain). Кроме того, он способен привлекать Sin3 комплекс, содержащий
гистондезацетилазы HDAC1 и HDAC2.
Мутации MeCp2 вызывают тяжелое заболевание – Rett синдром
У мышей с нокаутом MeCp2 развивается заболевание сходное с Rett синдромом
Для развития заболевания достаточно удалить ген MeCp2 только в мозговых
тканях (Nestin-creMeCp2 deletion)
нокаут MBD3 летален в силу того, что этот белок является структурным компонентом
комплекса ремоделирования хроматина NURD (у млекопитающих этот белок не
связывается с метилированной ДНК)
H3-K9-me2
Существует четкая корреляция между транскрипцией, ацетилированием H3 по
позициям 9/14 и присутствием характерных для активного хроматина метилированных
форм гистона Н3, равно как и корреляция между отсутствием транскрипции,
отсутствием ацетилирования H3 по позициям 9/14 и метилированием H3 и H4 по
позициям, характерным для неактивного хроматина
Особую группу белков, обеспечивающих
долговременную инактивацию генов
составляют белки Polycomb