Академический Документы
Профессиональный Документы
Культура Документы
Введение
Раздел 1
Раздел 2
Раздел 3
Раздел 4
Бонус
ЧТО ТАКОЕ МИКРОБИОЛОГИЯ
Наука, изучающая микроскопические существа (видимые под микроскопом),
называемые микроорганизмами (микробами), их биологические признаки и
взаимоотношения с другими организмами.
Объекты изучения:
Систематика, морфология, физиология, биохимия, эволюция, роль в экосистемах,
практическое использование.
Разделы:
Общая микробиология, медицинская, промышленная (техническая), космическая,
геологическая, сельскохозяйственная, ветеринарная микробиология.
ПРИКЛАДНЫЕ АСПЕКТЫ
МИКРОБИОЛОГИИ
1. Систематика
1. Классификация
1. Таксономия
2. Нумерическая (численная) таксономия
1. Гено- и фенотипические характеристики
2. Идентификация
3. Номенклатура
2. Ряд других терминов для характеристики микроорганизмов
СИСТЕМАТИКА
Распределение микроорганизмов в соответствии с их происхождением и биологическим сходством.
Систематика занимается всесторонним описанием видов организмов, выяснением степени родственных
отношений между ними и объединением их в различные по уровню родства классификационные единицы-
таксоны.
Основные вопросы, решаемые при систематике (три аспекта, три кита систематики)- классификация,
идентификация и номенклатура.
КЛАССИФИКАЦИЯ
Распределение (объединение) организмов в соответствии с
их общими свойствами (сходными генотипическими и
фентипическими признаками) по различным таксонам.
Классификация живых организмов называют
таксономией и направлена она на классификацию
живых организмов путем их дифференциации и
установления отношений между группами организмов.
Организмы сгруппированы в три системы доменов
(эукариоты, археи и бактерии) в первую очередь на
основе типа клеток.
Различают два вида классификаций: филогенетические,
или «естественные», и искусственные
ТАКСОНОМИЯ
Наука о методах и принципах распределения
(классификации) организмов в соответствии с их
иерархией. Наиболее часто используют следующие
таксономические единицы (таксоны)- штамм, вид, род.
Последующие более крупные таксоны- семейство,
порядок, класс.
Живые организмы
Домен «Archae»
(архебактерии)
Бактерии (Bacteria) Археи (Archaea)
– характеризуются отсутствием ядра и других – схожи с бактериями по типу организации
внутренних мембранных структур, простым клетки, однако устройство большинства
цитоскелетом, не позволяющим осуществлять молекулярных систем роднит их с
эндоцитоз и экзоцитоз, размножением путём эукариотами.
бинарного деления. – Важным отличием архей от других доменов
– только в пределах домена Bacteria является альтернативный химический состав
встречается пептидогликан в составе мембран: они построены на основе простых
клеточной стенки. эфиров фосфоглицерола и терпеновых
спиртов.
Штамм- любой конкретный образец (изолят) данного вида. Штаммы одного вида, различающиеся по
антигенным характеристикам, называют серотипами (серовариантами- сокращенно сероварами), по
чувствительности к специфическим фагам- фаготипами, биохимическим свойствам- хемоварами, по
биологическим свойствам- биоварами и т.д.
Колония- видимая изолированная структура при размножении бактерий на плотных питательных
средах, может развиваться из одной или нескольких родительских клеток. Если колония развилась из
одной родительской клетки, то потомство называется клон.
Культура- вся совокупность микроорганизмов одного вида, выросших на плотной или жидкой
питательной среде.
Чистая культура - совокупность однородных микроорганизмов, выделенных на питательной среде,
сходных по основным свойствам
МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ ПРИЗНАКИ
Микроорганизмы
Бактерии Дрожжи
Грибы
БАКТЕРИИ
Диплококки: пневмококки
Палочковидные бактерии
Характеризуются по взаимному расположению в чистой культуре, характеру концов,
способности образовывать споры.
Campylobacter
Helicobacter
СПИРОХЕТА
СТРОЕНИЕ БАКТЕРИАЛЬНОЙ
(ПРОКАРИОТИЧЕСКОЙ) КЛЕТКИ
• Внутреннее строение бактериальной (прокариотической) клетки.
• 1 - гранулы поли-В-оксимасляной кислоты,
• 2 - жировые капли,
• 3 - включения серы,
• 4 - трубчатые тилакоиды,
• 5 - пластинчатые тилакоиды,
• 6 - выросты цитоплазматической мембраны,
• 7 - хроматофоры (участки протопласта, несущие пигмент),
• 8 - нуклеоид,
• 9 - рибосомы прокариотической клетки,
• 10 - цитоплазма,
• 11 - слизистая капсула,
• 12 - жгутики,
• 13 - клеточная оболочка,
• 14 - мезосома,
• 15,16 - газовые вакуоли,
• 17 - гранулы полисахаридов,
• 18 - гранулы полифосфатов,
• 19 - цитоплазматическая мембрана,
• 20 - базальное тельце.
КЛЕТОЧНЫЕ СТЕНКИ
ГРАММ+ И ГРАММ-
С помощью способа окраски, впервые предложенного в 1884 г.
Кристианом Грамом, бактерии могут быть разделены на две
группы: грамположительные и грамотрицательные.
Грамположительные организмы способны связывать некоторые
анилиновые красители, такие, как кристаллический фиолетовый,
и после обработки иодом, а затем спиртом (или ацетоном)
сохранять комплекс иод-краситель. Те же бактерии, у которых
под влиянием этилового спирта этот комплекс разрушается
(клетки обесцвечиваются), относятся к грамотрицательным.
СТРОЕНИЕ БАКТЕРИИ
В бактериальной клетке различают основные структуры(то есть те, которые встречаются
у всех бактерий) и дополнительные (только у некоторых).
ОСНОВНЫЕ
Нуклеоид
Плазмида
Цитоплазма
Рибосомы
Клеточная стенка
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ
Споры
Слизь
Жгутики
Включения
Основные части бактерии
• Нуклеоид – ядерное вещество, содержащее двухцепочную ДНК, закрученную в спираль (без белков гистонов), не образует ядрышек и не имеет ядерной оболочки. Эта ДНК
кодирует основную генетическую информацию.
• Плазмида - еще одна структура, представляющая собой двухцепочную ДНК. Она может быть связана с нуклеоидом или быть автономной, поэтому ее сложно
классифицировать как основную или дополнительную структуру. Главная ее функция - хранение и передача дополнительной, приспособительной информации, такой как
токсинообразование, устойчивость к антибиотикам и т.п.
• Цитоплазма - это сложная коллоидная система, состоящая из воды (75 %), минеральных соединений, белков, РНК и ДНК, которые входят в состав органелл нуклеоида,
рибосом, мезосом, включений.
• Цитоплазматическая мембрана располагается непосредственно под клеточной стенкой и ограничивает цитоплазму. Она участвует в регуляции осмотического давления,
транспорте веществ, энергетическом метаболизме. ЦПМ способна образовывать инвагинации внутрь клетки - мезосомы. Их функция до конца не ясна. На сегодняшний день
мнения ученых разделились: одни считают их артефактами, возникшими при приготовлении препарата, другие предполагают, что это дополнительный источник энергии,
необходимый при быстром росте бактерии, третьи утверждают, что мезосомы связаны с нуклеоидом и участвуют в делении и спорообразовании.
• Рибосомы - рибонуклеопротеиновые частицы, состоящие из двух субъединиц, отвечающие за синтез белка. Перед началом синтеза белка происходит объединение этих
субъединиц в одну – 70 S (это скорость оседания этой структуры в ультрацентрифуге).
• Клеточная стенка - плотный биогетерополимер, обеспечивающий защитную, рецепторную, антигенную функции, поддерживающий постоянную форму и размер бактерии,
участвующий в делении и спорообразовании, а также в транспорте веществ и регуляции осмотического давления. В зависимости от строения клеточной стенки бактерии
делят на толстостенные (Грам+) и тонкостенные (Грам-).
СПОРЫ
Споры - округлые или овальные образования, формирующиеся при неблагоприятных условиях.
Процесс происходит в несколько этапов. Сначала образуется проспора - структура в которой
концентрируется вся ДНК клетки. Она окружена несколькими оболочками - два слоя
цитоплазматической мембраны, между которыми находится измененный пептидогликан, который
теперь называется кортекс. Эта проспора находится внутри бактериальной клетки. Постепенно
протоспора поглощает дипиколиновую кислоту и кальций, теряет воду и превращается в полноценную
спору. Такое строение обеспечивает высокую устойчивость к воздействию неблагоприятных факторов,
в том числе термо- и кислотоустойчивость. Спорообразование присуще грамположительным
бактериям, чаще всего родов Bacillus и Clostridium. В благоприятных условиях споры прорастают,
снова образуя вегетативные формы. Споры бактерий НЕ участвуют в размножении
КАПСУЛА, МИКРОКАПСУЛА, СЛИЗЬ
• Капсула (толщина более 0,2
мкм)/микрокапсула (менее 0,2 мкм) - слизистая
структура, образованная полисахаридами (реже
полипептидами), обеспечивающая дополнительную
защиту, а также играющая роль антигена. Поскольку
она обладает гидрофильностью, то препятствует
фагоцитозу бактерии. Выделяют
истиннокапсульные бактерии (род Klebsiella) –
сохраняют капсулообразование и при росте на
питательных средах, а не только в макроорганизме;
ложнокапсульные – образуют капсулу только при
попадании в макроорганизм.
• 2 типа:
- выглядят как пили 1 типа, но не вызывают гемагглютинацию и не способны образовывать пленки;
- считаются мутантной формой пилей 1 типа.
• 4 типа:
- обеспечивают контакт внутри колонии бактерий, необходимый для скользящего движения друг
относительно друга.
• Включения - это запасные питательные вещества, находящиеся в клетке в виде гранул. По химической
структуре это может быть гликоген, крахмал, сера, полифосфаты (волютин), бета-оксимасляная кислота
и др.
РАЗМНОЖЕНИЕ
Для бактерий характерны следующие виды размножения:
• бинарное деление на две части- деление происходит симметрично относительно
поперечной и продольной оси, образуются одинаковые дочерние клетки
почкование- вариант бинарного деления, образующаяся на одном из полюсов
почка растет до размеров материнской клетки и отделяется;
• симметрия присутствует только относительно продольной оси множественное
деление - клетка претерпевает ряд последовательных быстрых бинарных
делений внутри фибриллярного слоя материнской клетки, что приводит к
образованию баеоцитов – мелких клеток, количество которых колеблется от 4 до
1000, в результате разрыва клеточной стенки материнского организма баеоциты
выходят наружу;
• размножение спорами;
• путем фрагментации клеток, имеющих нитевидную форму;
• конъюгация (половой процесс, обмен клетками генетическим материалом);
• трансформация (перенос «голой» ДНК);
• трансдукция (перенос генетической информации при помощи бактериофагов).
РОСТ И СПОСОБЫ РАЗМНОЖЕНИЯ БАКТЕРИЙ
• Клетки большинства грамотрицательных бактерий делятся путем
перетяжки
Геном Метаболизм
Цитокинез сопряжён с митозом не сопряжён Синтез меланина в мертвых клетках в живых клетках
1 2 7
4
ТИПЫ КОНИДИОГЕНЕЗА У
ГРИБОВ
1. Таллический тип
2. Холобластический тип
3. Энтеробластический тип
a) Общий вид
b) Детали формирования цепочки
конидий
ПЛОДОВЫЕ ТЕЛА ГРИБОВ
РАЗНЫХ ФОРМ
На питательном субстрате мицелиальные грибы образуют колонии различного вида:
пушистые, нитевидные, паутинообразные, ватоподобные или мучнистоподобные.
Вегетативный мицелий большинства грибов не окрашен. Плодоносящий мицелий
молодых колоний грибов белого или сероватого цвета
ЗИГОСПОРЫ МУКОРОВЫХ
ГРИБОВ
• Phycomyces;
• Mortierella;
• Zygorrhynchus;
• Piptocephalis;
• Absidia.
ХЛАМИДОСПОРЫ
a) базидии с
базидиоспорами:
1. одноклеточная
базидия;
2. многоклеточная
базидия;
b) сумка (аскус) с
аскоспора-ми;
c) зигоспора
ГАПЛОИДИЗАЦИЯ
ГРИБЫ
В группу организмов, обозначаемых как грибы, входит большое число независимо
возникших или очень давно разошедшихся эволюционных линий. Среди них имеются
как амёбоподобные животные, так и потерявшие хлорофилл водоросли. Три главные
эволюционные линии, которыми занимаются микологи, показаны на схеме.
MYXOMYCOTA
Группа миксомицетов, или слизевиков, объединяет организмы, вегетативная
фаза которых представлена плазмодием - голой цитоплазматической массой,
окруженной перипластом и способной к амебообразным перемещениям, или
псевдоплазмодием - агрегацией амебообразных клеток (миксамеб), также
способных к синхронному движению. При спороношении плазмодий
преобразуется в один или группу спорангиев, в которых формируются
покоящиеся споры, покрытые целлюлозными (реже хитиновыми) оболочками.
Следовательно, в вегетативной фазе миксомицеты сходны с животными, а в
генеративной - с грибами. Первый серьезный исследователь миксомицетов -
знаменитый немецкий ботаник Антон Де Бари - назвал их поэтому Mycetozoa,
т.е. грибы-животные. Деление миксомицетов на классы основано на строении
плазмодия, прорастании спор и других признаках.
HETEROCONTAE
Отдел объединяет около 600 видов преимущественно микро-, реже макроскопических
эукариотических водорослей желто-зеленого, светло- или темно-желто-зеленого, реже зеленого
цвета, иногда бесцветных. Размеры их колеблются от 0,5-1,5 мкм (Chloridella glaciales Kol) до
нескольких миллиметров в диаметре (Botrydium Wallr.) или до десятков сантиметров в длину (нити
Tribonema Derb. et Sol., Vaucheria D. С.). Индивиды одноклеточные, многоклеточные и
неклеточные, либо колонии индивидов (в том числе ценобиальные), активно подвижные и
неподвижные, прикрепленные и свободноживущие.
Наблюдаются почти все типы структуры вегетативного тела от монадного до сифонального,
исключая сифонокладальный. Преобладающее большинство желтозеленых водорослей имеет
коккоидный тип структуры (Mischococcales), реже наблюдаются монадный (Chloramoebales) и
гемимонадный (Heterogloeales), ризоподиалъный (Rhizochloridales), сарциноидный (Chlorellidium
Visch. et Pasch., Chlorellidiopsis Pasch.), нитчатый (Neonemataceae, Tribonemataceae), разнонитчатый
(Heterococcus Chod.), псевдопаренхиматозный (Chaetopedia Pasch.), паренхиматозный (Chloropedia
Pasch.) и сифональный (Botrydiales).
ТИПЫ СТРУКТУРЫ ВЕГЕТАТИВНОГО
ТЕЛА ЖЕЛТОЗЕЛЕНЫХ ВОДОРОСЛЕЙ
Ascomycetes
спорообразующие ТАКСОНОМЕТРИЯ ДРОЖЖЕЙ Basidiomycetes Deuteromycetes
Saccharomycetaceae
Дрожжи относятся к эукариотам и являются одноклеточными микроскопическими грибами. На основании характера полового процесса или его отсутствия дрожжи относят к трем классам
высших грибов - аскомицетов (сумчатые, подкласс голосумчатые), базидиомицетов (небольшая часть дрожжей) и дейтеромицетов.
Класс аскомицетов (Ascomycetes) включает три семейства дрожжей: Saccharomycetaceae, Schizosaccharomycetaceae и Saccharomycodaceae. Характерными признаками грибов этого класса
Schizosaccharomycetaceae
являются половое спороношение и наличие в асках (сумках) двух, четырех или восьми аскоспор.
В пищевой и микробиологической промышленности широко используются дрожжи рода Saccharomyces из семейства Saccharomycetaceae. Сахаромицеты применяются при производстве
спирта, вина, пива, кваса, хлеба, хлебопекарных дрожжей. В пивоварении используют различные штаммы дрожжей вида Saccharomyces cerevisiae, в хлебопечении - дрожжи видов
Saccharomyces cerevisiae и Candida milleri (ранее Saccharomyces minor). Некоторые представители семейства Saccharomycodaceae (родов Nadsonia, Saenko) участвуют в брожении при
Saccharomycodaceae
производстве хересных и шампанских вин. Все остальные виды дрожжей являются посторонними («дикими»), контаминирующими биотехнологический процесс на разных его стадиях.
Несовершенные дрожжи класса дейтеромицетов (Deuteromycetes) - это либо анаморфы известных аскомицетовых или базидомицетовых грибов, либо виды, для которых половая стадия не
установлена или она отсутствует. В этом классе выделяют семейство Сandidaceae c признаками аскомицетового аффинитета и два семейства - Cryptococcaceae (не образуют баллистоспор) и
Sporobolomycetaceae (образуют баллистоспоры) - с признаками базидиомицетового аффинитета. Дрожжи родов Candida и Trichosporon способны образовывать псевдомицелий.
Saccharomyces
Способность дрожжей вызывать спиртовое брожение привела к широкому использованию этих микроорганизмов в промышленности. Однако самопроизвольное развитие дрожжей в
сахаросодержащих субстратах вызывает их порчу (вспучивание, забраживание, изменение запаха и вкуса).
Техническое значение дрожжей основано на их способности превращать сахар в этиловый спирт и углекислый газ. В связи с этим издавна они получили общее название сахарных грибов,
Candida способны
или сахаромицетов. Trichosporon
образовывать способны
Дрожжи отличаются высоким содержанием белков и витаминов (Bi, Вз, В6, никотиновой кислоты).
псевдомицелий образовывать
псевдомицелий
СЕМЕЙСТВО САХАРОМИЦЕТАЦЕЭ
(САХАРОМИЦЕТОВЫЕ, ИЛИ САХАРНЫЕ
ГРИБЫ)
1-3 - Sprobolomyces,
световой микроскоп,
4 – Bulleromyces,
сканирующий
электронный микроскоп.
ХЛАМИДОСПОРЫ У ДРОЖЖЕЙ
1 – Phaffia rhodozyma,
2 – Metschnikowia pulcherrima,
3 – хламидоспоры на мицелии у
Candida albicans.
КАПСУЛЫ ДРОЖЖЕЙ ПРИ РАЗЛИЧНЫХ
СПОСОБАХ МИКРОСКОПИРОВАНИЯ
Оптическая микрофотография,
показывающая появление дрожжей
Saccharomyces cerevisiae (A) и Brettanomyces
bruxellensis (B), присутствующих в посевном
материале. Стрелки указывают на стон
клеток. Увеличение в 1000 раз.
РОД CANDIDA
Основные представители этого рода - C. mycoderma, C. utilis, C.
krusei, C. guillermondii - имеют клетки овальные или удлиненно-
цилиндрические. Размеры клеток (4-16) х (2-5) мкм. Дрожжи этого
рода не образуют спор и являются аспорогенными. Многие
представители этого рода являются вредителями в производстве
вина, пива, пекарских дрожжей. На поверхности сусла и пива часто
образуют плотную белую или сероватую сухую пленку. Вызывают
помутнение пива, придают ему неприятный вкус и запах.
В процессе накопления биомассы при производстве пекарских
дрожжей дрожжи рода Candida конкурируют с культурными
дрожжами за питательные вещества субстрата, снижают
мальтазную активность готовых дрожжей.
РОД TORULOPSIS
Клетки дрожжей рода торулопсис мелкие, округлые или овальные, размерами (5-8) х (2-
5). Дрожжи этого рода часто выделяют из кефирных грибков (Torulopsis kefiri).Дрожжи
вида Torulopsis colliculosa являются вредителями пивоваренного и дрожжевого
производства.
РОД RHODOTORULA
Rhodotorula roseum - клетки округлые
или овальные, одиночные, соединенные
в пары, псевдомицелия не образуют.
Размеры клеток (5-8) х (2,5-5,0) мкм. На
питательном агаре R.. roseum образует
круглые блестящие колонии розового
цвета. При размножении на
поверхности пищевых продуктов
вызывают их пигментацию.
ОПРЕДЕЛЕНИЕ КОЛИЧЕСТВА
МЕРТВЫХ КЛЕТОК
Содержание мертвых клеток - важный показатель качества пивных и пекарских дрожжей. В
дрожжах хорошего качества должно содержаться не более 5 % мертвых клеток. Увеличение
количества мертвых клеток указывает на наличие неблагоприятных факторов при выращивании
дрожжей. При значительном количестве мертвых клеток возможны нарушения технологического
процесса: медленное брожение, развитие посторонних видов микроорганизмов.
Термическая Холодная
Прокаливание и обжигание в пламени спиртовки Использование дезинфектантов и антисептиков
Кипячение Стерилизация фильтрованием
Сухожаровая (горячим паром) стерилизация Глубинные Мембранные
Используется в тех случаях, когда культуры не выдерживают лиофилизации (спирохеты, микоплазмы, различные
вирусы). Микроорганизмы замораживают либо в рефрижераторах (от 15 – 12 °С до – 80 °С) либо используют
рефрижераторы с азотом (от – 150 °С до – 196 °С). При хранении бактерий в жидком азоте используют
криопротекторы двух типов:
1) глицерин и диметилсульфоксид, которые легко проходят через клеточную мембрану и обеспечивают как
внутри-, так и внеклеточную защиту;
2) сахароза, глюкоза, полиэтиленгликоль обеспечивают защитное действие на наружной поверхности клеточной
мембраны.
По 0,4 мл суспензии клеток (108 кл/мл) разливают в специальные ампулы, которые запаивают. Далее проводят
двухэтапное охлаждение: с медленной (снижение температуры 1 °С/мин) и быстрой (снижение температуры 15–30
°С/мин) скоростью. Чтобы оживить замороженные культуры, их быстро оттаивают при 37 °С.
К основным преимуществам криогенного сохранения микроорганизмов можно отнести: малую вероятность
заражения культуры, сохранение в стабильном состоянии свойств микроорганизмов, небольшие временные и
материальные затраты, возможность использования замороженных культур в качестве прямого инокулята.
СПОСОБЫ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ
МИКРООРГАНИЗМОВ
Дают следующее окрашивание
красное голубое (синее) фиолетовое желто- зеленое
коричневое
Грамположительные
(фиолетовые) кокки и
грамотрицательные
(красные) палочки
Стрептококки -это кокки,
расположенные цепочками
МЕТОДЫ ОКРАСКИ
• Метод Циля-Нильсена –
дифференцирует • Метод Пешкова – клеточная стенка
кислотоустойчивые и
некислотоустойчивые
бактерии – принципиальное • Метод Романовского-Гимзы – универсальный –
значение в диагностике окраска нуклеоида, риккетсий, хламидий,
туберкулеза спирохет
МЕТОД ГРАМА
При простом способе окраски спора не прокрашивается – в этом случае видны только эндоспоры
как бесцветные образования в клетке
Эндоспоры в теле клетки может располагаться:
• 1. центрально — возбудитель сибирской язвы Вacillus anthracis;
• 2. терминально — на конце палочки (возбудитель столбняка Clostridium Tetani);
• 3. субтерминально — ближе к концу (возбудитель ботулизма, Clostridium botulinum).
Способность бактерий образовывать споры, различающиеся по форме размерам и локализации в
клетке, является таксономическим признаком, который используется для их дифференцировки
метод Бурри-Гинса
(цитохимический)
• Капсулы имеют консистенцию цель метода Выявление капсулы у бактерий в чистой
геля, плохо удерживают краситель, культуре
и для их выявления чаще всего основной краситель не окрашивается, применяется оттеняющее
вещество - тушь
применяют методы негативного протрава -
контрастирования дифференцирующее - Str.pneumoniae
вещество Простой метод (фуксин)
• Капсула выявляется при любом дополнительный карболовый раствор фуксина
методе окраски в виде краситель
неокрашенной зоны между способ фиксации в пламени спиртовки (в этаноле) до
окрашенными телом бактерий и препарата-мазка окрашивания
этапы окраски В каплю туши добавить каплю жидкости с
субстратом. микроорганизмами и растереть тонким слоем
как мазок крови;
• При простом методе и методе Высушить и зафиксировать;
Грама достаточно не промывать Окрасить фуксином Циля 1 мин.;
мазок на последнем этапе окраски Высушить
сущность метода Капсула не окрашивается, задерживает тушь на
поверхности, а фуксин окрашивает
бактериальную клетку
Метод Бурри-Гинса: на
фоне туши видны
красные палочки,
окруженные бесцветной Грамположительные палоч
капсулой рода Bacillus
Окраска по Граму
ВКЛЮЧЕНИЯ ВОЛЮТИНА
метод Нейссера
Метод Леффлера (простой метод) (цитохимический)
• Для окраски используют щелочной цель метода Выявление включений - зёрен волютина
основной краситель раствор уксуснокислой синьки
р-р метиленового синего, который протрава раствор Люголя
наносят на 3 - 5 мин на Включения волютина постоянно дифференцирующее -
вещество
фиксированный мазок, после чего имеют возбудитель дифтерии- дополнительный раствор везувина
Corynebacterium diphtheriae, краситель
смывают водой, мазок дрожжеподобные грибы рода
способ фиксации в пламени спиртовки до окрашивания
препарата-мазка
высушивают и микроскопируют. Candida, что является этапы окраски Окрасть уксуснокислой синькой 1 мин.;
• Протоплазма бактерий таксономическим признаком
Промыть водой;
Обработать раствором Люголя 30 сек.;
окрашивается в голубой цвет, Окрасить везувином 30 сек.;
Промыть водой
волютиновые зерна -в темно- Высушить
сущность метода Включения волютина содержат
синий. полифосфаты и имеют слабощелочной рН и
окрашиваются синькой, которая
закрепляется Люголем, цитоплазма имеет
кислый рН и окрашивается везувином
этапы окраски Мазок протравливать в 10% водном растворе танина 6-8 мин.;
Промыть водой;
Окрашивать водным раствором фуксина 30-60 сек.;
Высушить
сущность метода Танин уплотняет клеточную стенку бактерий, и большая часть фуксина задерживается
в ней
микроскопическая картина (рисунок с пояснением) КС –красная; цитоплазма -розовая
метод Романовского-Гимзы
(универсальный)
цель метода Дифференциальное окрашивание
отдельных групп м/о и выявление
нуклеоида
основной краситель краситель Романовского-Гимзы
(азур, эозин, метиленовый синий)
протрава соляная кислота
дифференцирующе -
е вещество
дополнительный -
краситель
способ фиксации в жидкости Карнуа 15 мин. перед
препарата-мазка окрашиванием
этапы окраски Провести кислотный гидролиз в
растворе соляной кислоты при • Bacillus cereus окраска по Романовскому-Гимзе:
нагревании; цитоплазма розовая, нуклеоиды – фиолетовые
Промыть водой;
Окрашивают краской • Поскольку деление цитоплазмы происходит
Романовского-Гимзы 40-60 мин.;
Промыть водой;
несинхронно с репликацией, в растущей
Высушить культуре в одной клетке видны несколько
сущность метода Азур и метиленовый синий нуклеоидов.
окрашивают участки клетки со
слабощелочным рН, эозин с
кислым
РАЗДЕЛ 4
1. Виды вирусов
2. Виды вирионов
1. Бактериофаги
1. Преимущества
2. Строение бактериофага
3. Механизм действия бактериофагов
2. Вирусы
1. Структура вируса
2. Репродукция вируса
3. Реассортация вируса
4. Коронавирус
5. Коронавирус – схема строения вириона
6. Жизненный цикл коронавирусов
ВИДЫ ВИРУСОВ
(А. Примеры)
Из множества известных вирусов на схеме представлены лишь отдельные
представители. Все изображения даны при одинаковом увеличении. Вирусы,
размножающиеся только в бактериях, носят название бактериофаги (коротко: фаги).
Наиболее простое строение имеет фаг М13 (1). Он состоит из одной однонитевой
молекулы ДНК [онДНК (ssDNA)], содержащей примерно 7000 н.о. (н.о. — нуклеиновое
основание), окруженной белковой оболочкой из 2700 субъединиц, упакованных по
спирали. Оболочка вируса носит название капсид, а структура в целом —
нуклеокапсид. M13 используется в генной инженерии в качестве вектора (см. с. 256).
Фаг Т4 (1), один из наиболее крупных вирусов, имеет более сложное строение. В
«головке» вируса содержится двунитевая ДНК [днДНК (dsDNA)], насчитывающая
170000 н.о.
Патогенный для растений вирус табачной мозаики (2) построен аналогично M13, но
вместо ДНК содержит онРНК (ssRNA). K РНК-содержащим вирусам относится также
вирус полиомиелита (полиовирус), вызывающий детский паралич. Нуклеокапсид
вируса гриппа имеет дополнительную оболочку, заимствованную у плазматической
мембраны клетки-хозяина (B). На липидной оболочке фиксированы вирусные белки,
принимающие участие и инфицировании клетки-хозяина.
(Б. Капсид риновируса)
Риновирусы являются возбудителями так называемых «простудных заболеваний».
Капсид этого вируса имеет форму икосаэдра, геометрической фигуры, построенной из
20 равносторонних треугольников. Оболочка сформирована из трех различных белков,
расположенных в форме пентамеров и гексамеров.
ВИДЫ ВИРИОНОВ
Подсемейство Coronavirinae имеет
сфероидную форму с характерным
диаметром 120 –160 нм
Вирусы, входящие в род Torovirus, по
форме напоминают крендельки 100 –140
× 35 –50 нм
Вирусы рода Bafinivirus имеют
палочковидную (бациллоподобную)
форму 170–200 нм в длину и 75 –88 нм в
диаметре
БАКТЕРИОФАГИ
Бактериофаги — современные антимикробные препараты природного происхождения.
Это микроорганизмы, способные точечно уничтожать только болезнетворные бактерии.
Бактериофаги используются в профилактике и антибактериальной терапии заболеваний,
возбудителями которых являются патогенные бактерии.
ПРЕИМУЩЕСТВА
Преимущества бактериофагов перед антибиотиками заключаются в следующем:
они способны уничтожать бактерии, устойчивые к антибиотикам
свободно проникают в ткани организма человека и животного, не нарушая баланса
микрофлоры хозяина;
не вызывают побочных эффектов;
сочетаются со многими лекарственными препаратами;
оказывают иммуностимулирующее действие и не обладают иммуносупрессивным влиянием
Однако при использовании фагов в этих целях необходимо учитывать иммунные ответы
макроорганизма на их введение.
СТРОЕНИЕ БАКТЕРИОФАГА
Описание
Еще более неприятный вирус MERS-CoV, вызывавший ближневосточный респираторный
синдром является зоонозом, то есть резервуаром заболевания являются животные.
Первичными носителями, судя по всему, являются летучие мыши и, возможно, верблюды. От
человека к человеку он передавался с большим трудом, только при тесном контакте. Клиника
очень похожа на SARS, но отличается более агрессивным течением и большей летальностью.
Эпидемиология и летальность
Относительно благоприятным эпидемиологическим фактором была низкая контагиозность
этого коронавируса. Некоторые исследователи полагают, что основная часть заболевших
заразилась не от других людей, а от больных животных.
Уровень смертности среди инфицированных составляет, по разным данным, от 27% до 40%.
Всего было зарегистрировано 1154 подтвержденных случая и не менее, чем 431 погибший.
РАСПРОСТРАНЕНИЕ
Вспышка SARS-CoV-2, начавшаяся в Ухане, потенциально является одной из самых значительных
опасностей, с которыми сталкивалось человечество. Исходным резервуаром предположительно являются
коронавирусы летучих мышей, в частности азиатских подковоносов. В этом регионе Китая летучих
мышей употребляют в пищу, что сильно увеличивает риски межвидового переноса в случае мутации.
Инкубационный период зависит от источника вируса. При заражении от животного он составляет 6-12
дней. При заражении от человека — не более 5 дней.
Вирус может передаваться от человека к человеку и отличается высокой контагиозностью, что
радикально отличает его от предыдущих SARS-CoV и MERS-CoV. Есть такой показатель как basic
reproduction number — R0. Он показывает, сколько людей успевает заразить больной за период болезни.
Если число меньше 1, то эпидемия гаснет сама собой. Если больше, то оно определяет скорость
нарастания эпидемии и возможность пандемии. Например, у кори это число 12-18. Практически
достаточно посмотреть на больного издали, чтобы заразиться. Что-то аналогичное у краснухи. Обычный
грипп имеет R0 в районе 2-3.
Последние данные по SARS-CoV-2 говорят о диапазоне 3.3 — 5.47.
ТЯЖЕСТЬ ТЕЧЕНИЯ
Клиника очень похожа на SARS/MERS. Вначале гриппоподобное состояние, кашель, температура.
Затем резкое ухудшение состояния и появление проблем с дыханием на 8-9 сутки с развитием острого
респираторного синдрома. Вирус вызывает очень тяжелую пневмонию, разрушая клетки легочных
альвеол. Есть риски присоединения бактериальной инфекции.
Хуже всего в данной ситуации — большой процент пациентов, которые нуждаются в интенсивной
терапии. На данный момент это 976 человек из 4515 подтверждённых заражений. Такие пациенты не
могут лежать дома и пить чай с малиной. Им требуется госпитализация, ИВЛ, кислород и, возможно,
реанимация. Если соотношение будет сохраняться, то мы имеем потенциальные 200 000 пациентов
реанимации на каждый миллион населения. Обеспечить такое количество койко-мест и аппаратуры
всем нуждающимся практически невозможно.
Летальность пока очень сложно определить. При 4515 зараженных имеем 60 выздоровевших и 106
умерших. Пропорции 60/106 жуткие, но есть шанс, что через неделю начнут массово выздоравливать
заболевшие первой волны, которых начнут выписывать из больницы. Тем не менее проблема ресурсов
здравоохранения в мире остается самой большой проблемой для тяжелых больных.
ЛЕЧЕНИЕ
Пока отсутствует. Не ведитесь на фуфломицины, арбидолы и прочие *фероны. Бессмысленно
стимулировать иммунитет, если пациент не успеет синтезировать антитела до отказа дыхательной
системы. Препараты прямого действия на вирус пока не изучены, но, возможно, скоро будут
какие-то данные. По данным Lancet, пациенты получали антибиотики широкого спектра действия,
кортикостероиды как противовоспалительное и различные комбинации противовирусных.
Есть подозрение, что может оказаться эффективным довольно токсичный рибавирин, который сам
по себе обладает тератогенным воздействием (может вызывать уродства плода) и может приводить
к смерти из-за подавления кроветворения. Поэтому беременным его нельзя и применение строго
под присмотром врача. Он демонстрировал положительные эффекты на SARS.
«А вакцина?»
Не в ближайшее время. В лучшем случае к 2022-2023 году. 2020 год — испытания на животных.
При успешности, 2021 год — на людях, 2022 — тиражирование и производство, 2023 — начало
вакцинации. Если судить по проблемам с прошлыми коронавирусами, все будет дольше, .
ЖИЗНЕННЫЙ ЦИКЛ SARS-COV-2
Геном представлен одноцепочечной (+)РНК. Нуклеокапсид окружён белковой мембраной и липосодержащей внешней оболочкой, от которой отходят булавовидные
шиповидные отростки, напоминающие корону, за что семейство и получило своё название. Культивируют на культуре тканей эмбриона человека.
SARS-CoV-2 использует S-белок на короне для прикрепления к своему рецептору — ангиотензинпревращающему ферменту 2 (ACE2), а также к сериновой протеазе
TMPRSS2, как и вирус SARS-CoV (атипичной пневмонии). Клетка окутывает вирус своей мембраной, и образовавшийся мембранный пузырёк оказывается в
цитоплазме клетки. Два упомянутых белка-рецептора клетки трансформируют S-белок вируса таким образом, что мембраны вируса и клетки сливаются.
После проникновения в клетку вирус с помощью внутриклеточных мембран создаёт мембранные пузырьки, к которым прикрепляются специальные белковые
комплексы. В этих комплексах синтезируется копия геномной РНК вируса и короткие мРНК для синтеза белков вируса.
РНК вируса имеет 5'-метилированное начало и 3'-полиаденилированное окончание. Это позволяет вирусу инициировать на своих РНК сборки своих белков рибосомами
клетки, которая не в состоянии определить, это РНК вируса или РНК для белков самой клетки.
Коронавирусы имеют РНК около 26—30 тысяч пар оснований, это означает, что коронавирусы обладают крупнейшей несегментированной РНК среди всех известных
вирусов, то есть являются сложнейшими по структуре среди известных вирусов. Геном вируса состоит из более чем 20 000 нуклеотидов и кодирует два репликативных
полипротеина pp1a и pp1ab, из которых в следующий проход репликации/трансляции формируется копия РНК вируса, а также 8 отдельных мРНК-шаблонов для белков
вирусов, которые бесконечно их генерируют. Генерация белков M, S, HE и E, попадающих в мембранную липидную оболочку вируса, происходит на соответствующих
мРНК в эндоплазматическом ретикулуме клетки; белок же N, который будет окружать геномную РНК вируса, синтезируется на мРНК, плавающих в цитоплазме клетки.
После получения геномной РНК вируса и необходимых его белков эта РНК, окутанная белком N, приближается к сидящим на эндоплазматическом ретикулуме белкам и
взаимодействует с ними. В результате мембрана эндоплазматического ретикулума с находящимися в ней вирусными белками охватывает эту РНК, формируя вирион.
Вирионы затем высвобождаются из инфицированной клетки через экзоцитоз. После выхода вирионов из клетки она погибает.
ТОЧКИ ЗРЕНИЯ О МУТАЦИЯХ КОРОНАВИРУСА
НА ПРИМЕРЕ COVID-19 (SARS-COV-2)
Существует несколько точек зрения относительно того, как быстро мутирует коронавирус и к чему
это приводит.
По некоторым данным, новый коронавирус мутирует медленнее, чем другие РНК-содержащие вирусы
или вирус гриппа, для которого характерна частота мутаций 1 раз в 10 дней.
Исследования геномов SARS-CoV-2 в разных регионах мира показали, что все его разновидности
имеют общего предка, время появления вируса, и определили те его участки, где чаще всего
встречаются изменения.
Эти мутации сравнивались с вирусами SARS-CoV-1 и MERS-CoV, которые являются
предшественниками SARS-CoV-2. Выяснилось, что в то время, как у SARS-CoV-1 известны около 6
штаммов, а у MERS-CoV – 350 штаммов, у нового коронавируса на сегодняшний день изучены около
200 штаммов. Это подтверждает, что SARS-CoV-2 продолжает адаптацию в организме человека.
Есть также точка зрения, что чем больше вирус мутирует, тем быстрее он ослабевает и будет меньше
передаваться от одного человека к другому.
Спасибо за внимание!