Академический Документы
Профессиональный Документы
Культура Документы
ФЕРМЕНТЫ
Ф
ерменты можно определить как биологи или:
ческие катализаторы. Катализатором на
зывают вещество, ускоряющее реакцию, E+S ES EP E+P
но само в реакции не изменяющееся. Поскольку
ферменты представляют собой белковые моле Анаболизм и катаболизм
кулы, синтезируемые в живой клетке, их называ Совокупность всех химических реакций, проте
ют биологическими катализаторами. В любой кающих в клетке, составляет то, что мы называ
клетке человеческого тела содержатся тысячи ем метаболизмом. Метаболизм подразделяется на
ферментов. Они катализируют многочисленные анаболизм и катаболизм — два разных типа реак
химические реакции, протекающие здесь при ций, которые нередко протекают и в разных час
температурах, совместимых с жизнью, т. е. в пре тях клетки. Катаболические реакции, или реакции
делах от 5 до 40 °C. Чтобы эти реакции с той же распада, обычно сопровождаются высвобожде
скоростью осуществлялись вне организма, по нием энергии. По большей части это окисление
требовались бы высокие температуры и резкие и гидролиз. Анаболические реакции, или реакции
изменения некоторых других условий, что было синтеза, наоборот, требуют затрат энергии. Часто
бы для клетки губительным. Ферменты абсолют это реакции конденсации. Все эти реакции про
но необходимы, поскольку без них реакции в текают с участием ферментов. Примером фер
клетке протекали бы слишком медленно и не мента, участвующего в анаболизме, может слу
могли бы поддерживать жизнь. жить глутаминсинтетаза, катализирующая син
Вещество, превращения которого катализи тез аминокислоты глутамина из глутаминовой
рует данный фермент, называют субстратом этого кислоты и аммиака:
фермента. Соединяясь с субстратом, фермент Глутаминсинтетаза
образует короткоживущий ферментсубстрат Глутаминовая + Аммиак + АТФ Глутамин +
кислота
ный комплекс. В таком комплексе шансы на то,
что реакция произойдет, значительно возраста + Вода + АДФ + Фн
ют. По завершении реакции ферментсубстрат (АТФ — аденозинтрифосфат; АДФ — аденозин
ный комплекс распадается на продукт (или про дифосфат; Фн — неорганический фосфат). В ка
дукты) и фермент. Фермент в реакции не изменя честве примера фермента, участвующего в ката
ется и по ее окончании может снова взаимодей болизме, можно назвать мальтазу:
ствовать с новой молекулой субстрата:
Мальтаза
Крахмал + Вода Мальтоза
Субстрат + Фермент Фермент Комплекс
(S) (E) субстратный фермент–
комплекс (ES) продукт (EP) Метаболические пути
Фермент + Продукт (P) Обычно данное исходное вещество превраща
(Е) (продукты) ется в продукт (или продукты) через ряд про
Ферменты 153
межуточных соединений, в образовании кото зирует только расщепление пероксида во
рых принимают участие несколько фермен дорода.
тов, действующих последовательно один за 7. Катализируемая ферментом реакция об
другим. Такая последовательность реакций ратима.
составляет так называемый метаболический
путь. В клетке работает одновременно много 8. Активность ферментов меняется в зависи
метаболических путей. Реакции протекают со мости от pH и температуры, а также от
гласованно, подчиняясь строгой регуляции, концентрации как субстрата, так и самого
что объясняется специфической природой фермента (об этих факторах мы будем го
ферментов. Один фермент обычно катализи ворить в разд. 4.3).
рует только одну реакцию. Таким образом, 9. Ферменты снижают энергию активации
ферменты служат для регулирования происхо катализируемой реакции (разд. 4.1.1).
дящих в клетке реакций и обеспечивают над 10. В молекуле фермента есть активный
лежащую их скорость. центр, который вступает в контакт с суб
стратом. Этот активный центр имеет осо
бую форму (разд. 4.1.2).
4.1. Свойства ферментов
Ферменты характеризуются следующими основ
ными свойствами. 4.1.1. Энергия активации
1. Все они представляют собой глобулярные Представим себе смесь бензина и кислорода.
белки. Реакция между этими двумя веществами с тер
модинамической точки зрения возможна, но
2. Информация о них, как и о других белках,
она не пойдет без затраты некоторого количе
закодирована в ДНК.
3. Ферменты действуют как катализаторы
(см. выше). А
4. Их присутствие не влияет ни на природу,
ни на свойства конечного продукта (или
продуктов) реакции.
5. Ферменты действуют чрезвычайно эф
фективно, т. е. очень малое количество
фермента вызывает превращение боль
ших количеств субстрата. Одна молеку
ла каталазы способна, например, при
температуре тела разложить за одну се
кунду на воду и кислород около 600 ты
сяч молекул пероксида водорода. Мож Б
но сравнить эффективность каталазы и
такого, например, неорганического ка
тализатора, как диоксид марганца, доба
вив их по отдельности к пероксиду водо
рода и измерив скорость выделения кис
лорода. (Хорошим источником каталазы
служит печень). В среднем ферменты
способны катализировать около 1000
реакций в секунду. Без катализаторов
реакции протекали бы в миллионы раз Рис. 4.1. А. Энергия активации для катализируемой
медленнее. и некатализируемой реакции. Б. Аналогичная ситу
ация — когда валун скатывается с холма, высво
6. Ферменты высокоспецифичны, т. е. один бождается больше энергии, чем было затрачено на
фермент катализирует обычно только од то, чтобы поднять его на холм и заставить ска
ну реакцию. Каталаза, например, катали титься.
154 Глава 4
ства энергии, поступившей, например, в фор
ме простой искры. Так же обстоит дело и со
спичкой. Содержащиеся в спичечной головке
вещества могут вступить в реакцию, суммар
ным итогом которой будет выделение энергии,
но чтобы запустить реакцию, придется сначала
затратить небольшое количество энергии (до
статочно тепловой энергии, выделяющейся,
когда мы чиркаем спичкой о коробок). Энер
гия, необходимая для того, чтобы заставить ве
щества вступить в реакцию, называется энер
гией активации. Ферменты, действуя как ката
лизаторы, снижают энергию активации
(рис. 4.1). Они повышают общую скорость ре
акции, не изменяя в скольконибудь значи
тельной степени температуру, при которой эта
реакция протекает.
В 1959 г. Кошланд (Koshland) предложил нять свою функцию (рис. 4.3). Подходящей
новую интерпретацию гипотезы «ключа и зам аналогией в этом случае может служить пер
ка», получившую название гипотезы «индуциро чатка, которая при надевании на руку соответ
ванного соответствия». На основе данных, по ствующим образом изменяет свою форму. По
зволяющих считать ферменты и их активные мере выяснения отдельных деталей механизма
центры физически более гибкими, чем это ка различных реакций в эту гипотезу вносятся
залось вначале, он заключил, что субстрат, со уточнения.
единяясь с ферментом, вызывает какието из Представление о том, как работает фермент,
менения в структуре его активного центра. можно получить с помощью рентгеноструктур
Аминокислотные остатки, составляющие ак ного анализа и компьютерного моделирования.
тивный центр фермента, принимают опреде Рис. 4.4 иллюстрирует это на примере фермента
ленную форму, которая дает возможность фер лизоцима.
менту наиболее эффективным образом выпол
156 Глава 4
А Б В
Рис. 4.4. Созданные на компьютере модели третичной структуры лизоцима до и после присоединения субстрата,
показывающие, как работает этот фермент. А. Вид сбоку. Активный центр имеет форму щели, проходящей по
всей толще молекулы. Б. Вид сбоку. Активный центр с находящейся в нем молекулой субстрата. Обратите внима
ние на некоторое изменение формы фермента, вызванное присоединением субстрата. Это пример «индуцирован
ного соответствия», постулированного Кошландом в 1959 г. Субстрат лизоцима представляет собой короткую
олигосахаридную цепь, легко умещающуюся в активном центре и расщепляемую ферментом. Такие олигосахариды
входят в состав бактериальных клеточных стенок и их разрушение влечет за собой гибель бактерий — клеточные
стенки утрачивают присущую им жесткость и клетки лопаются под действием осмотических сил. Лизоцим —
широко распространенный фермент, выполняющий защитную функцию; он содержится в слезах, слюне и в слизи
носовой полости. В. Вид спереди. Активный центр с находящейся в нем молекулой субстрата. Г. Компьютерная
модель лизоцима с субстратом в активном центре.
Ферменты 157
4.3.3. Температура
С повышением температуры ускоряется движе
ние молекул, вследствие чего у молекул субстра
та и фермента оказывается больше шансов стол
кнуться друг с другом. В результате увеличивает
ся и вероятность того, что реакция произойдет.
Температура, обеспечивающая максимальную
активность, называется оптимальной температу
рой. Если температура поднимается выше этого Рис. 4.9. Ход ферментативной реакции при разных
уровня, скорость ферментативной реакции сни температурах.
жается, несмотря на увеличение частоты столк
новений. Происходит это вследствие разруше менты используются в качестве добавок к сти
ния вторичной и третичной структур фермента, ральным порошкам для стирки в горячей воде.
иными словами, вследствие того, что фермент Когда температура приближается к точке замер
претерпевает денатурацию (рис. 4.8). Молекула зания или оказывается ниже ее, ферменты инак
фермента развертывается и его активный центр тивируются, но денатурации при этом не происхо
постепенно утрачивает присущую ему форму. дит. С повышением температуры их каталитиче
Наиболее чувствительны к воздействию высо ская активность вновь восстанавливается.
кой температуры водородные связи и гидрофоб В наше время для длительного хранения пи
ные взаимодействия. щевых продуктов широко используют такой
Температурный оптимум для большинства способ, как быстрое их замораживание. Оно
ферментов млекопитающих лежит в пределах предотвращает рост и размножение микроорга
37–40 °C. Существуют, однако, ферменты с бо низмов, а также инактивирует их пищеваритель
лее высоким температурным оптимумом; у бак ные ферменты, так что они оказываются уже не в
терий, живущих в горячих источниках, он может, состоянии вызвать разложение пищевых про
например, превышать 70 °C. Именно такие фер дуктов. Инактивируются также и ферменты,
находящиеся в самих пищевых продуктах. Замо
роженные продукты необходимо хранить при
низких температурах, не допуская их размора
живания. Последнее следует делать непосредст
венно перед приготовлением пищи.
Рис. 4.10. Зависимость скорости ферментативной ре pH раствора Время сбора газа,
мин
акции от pH.
4,00 20,00
При более высоких и более низких pH актив 5,00 12,50
ность фермента снижается. С понижением pH 6,00 10,00
7,00 13,60
возрастает кислотность и увеличивается концен
8,00 17,40
трация H+ионов. Увеличивается, следователь
но, количество положительных зарядов в среде.
Сдвиг pH меняет заряд ионизированных кислот Представьте эти результаты в виде графика
ных и основных групп, что ведет к разрушению и объясните их.
ионных связей, участвующих в поддержании
специфичной формы молекул фермента (разд.
3.5.3). В результате изменяется форма молекул
фермента и в первую очередь форма его активно
Пепсин1 2,00
Сахараза 4,50
Энтерокиназа 5,50
Амилаза слюны 4,80
Каталаза 7,60
Химотрипсин 7,00–8,00
Липаза поджелудочной железы 9,00
Аргиназа 9,70
1 Содержится в желудке вместе с соляной кислотой. Рис. 4.11. Влияние pH на активность трех фермен
тов — А, В и С.
160 Глава 4
4.3.5. Лабораторные работы 9. Сразу же включите отсчет времени и вновь
поставьте пробирку, содержащую реакци
Опыт 4.1. Изучение влияния концентрации онную смесь, в водяную баню.
фермента на гидролиз сахарозы,
10. В течение всего опыта непрерывно пере
катализируемый сахаразой (инвертазой)
мешивайте реакционную смесь.
Материалы и оборудование 11. После 30 с инкубации перенесите 1 мл
смеси в пробирку 1.
2%ный раствор сахарозы
12. С интервалом в 30 с отберите такие же
1, 0,75 и 0,5%ный растворы сахаразы (инвертазы)
пробы и перенесите их по очереди в про
Реактив Бенедикта
бирки 2—8.
12 пробирок со штативом
Водяные бани с температурой 38 и 100°C 13. Нагрейте пробирки 1—8 в водяной бане
Стеклянные палочки с температурой 100 °C в течение 5 мин. От
Таймер метьте время первого появления кирпич
Дистиллированная вода нокрасного осадка, свидетельствующего
Этикетки о положительной реакции на редуцирую
Бунзеновская горелка щий сахар.
14. Повторите тот же эксперимент, использо
Методика вав на этот раз прокипяченый раствор
фермента (см. п. 3).
1. Добавьте 2 мл прозрачного синего реакти 15. Повторите всю последовательность про
ва Бенедикта к 2 мл прозрачного бесцвет цедур дважды: с 0,75%ным и 0,5%ным
ного 1%ного раствора сахаразы. Нагрейте растворами сахаразы.
смесь на водяной бане при 100 °C в тече 16. Запишите ваши наблюдения и объясните
ние 5 мин (реакция Бенедикта). полученные результаты.
2. Повторите процедуру 1 с 2 мл прозрачного
бесцветного 2%ного раствора сахарозы, Опыт 4.2. Изучение распределения каталазы
а затем с 2 мл дистиллированной воды. в намоченных семенах гороха и влияния температуры
3. 5 мл 1%ного раствора сахаразы доведите на активность этого фермента
до кипения.
Каталаза — это фермент, катализирующий раз
4. В восемь чистых сухих пробирок с этикет ложение пероксида водорода с образованием
ками 1–8 налейте по 1 мл реактива Бене молекулярного кислорода, выделяющегося в ви
дикта. де пузырьков газа:
5. Налейте 5 мл 2%ного раствора сахарозы Каталаза
в пробирку с этикеткой S и поместите на 2H2O2 2H2O + O2
водяную баню, в которой на протяжении
Пероксид водорода образуется в некоторых
всего эксперимента поддерживается тем
растительных и животных клетках в качестве по
пература 38 °C.
бочного продукта метаболизма. Соединение это
6. Налейте 5 мл 1%ного раствора сахаразы токсично для клеток, и каталаза обеспечивает
в пробирку с этикеткой Е и поместите ее эффективное его удаление. Каталаза — один из
в водяную баню с температурой 38 °C. наиболее быстро работающих ферментов.
7. Выдержите обе пробки вместе с их содер
жимым в водяной бане в течение 5 мин для Материалы и оборудование
того, чтобы они приобрели нужную тем
пературу. Горсть намоченного гороха
Раствор пероксида водорода
8. Добавьте раствор фермента к раствору Пробирки со штативом
сахарозы и переверните пробирку, чтобы Водяные бани с температурой 40, 50, 60, 70, 80 и 100 °C
хорошо перемешать эти два раствора. Часы
Ферменты 161
Термометр Дистиллированная вода
Скальпели, ножницы и пинцеты Исходный раствор амилазы (такой, какая содержится в
Держатель для пробирок слюне)
Стеклянная палочка
Белая кафельная плитка Методика
1. Сполосните рот 5 мл дистиллированной
Методика воды и выплюньте эту воду.
1. Убедитесь в наличии каталазы. Для этого 2. Наберите в рот 10 мл дистиллированной
разомните одну горошину и нанесите на воды, пополощите в течение 1 мин и эту
нее несколько капель пероксида водорода. жидкость соберите.
2. Снимите с трех горошин кожуру и про 3. Доведите объем этого раствора амилазы
верьте на каталазу по отдельности кожуру слюны до 40 мл дистиллированной водой.
и семядоли. 4. Проверьте растворы амилазы, крахмала и
3. Поставьте две пробирки с дистиллирован буферные растворы на присутствие в них
ной водой в водяную баню с температурой редуцирующих сахаров с помощью реак
40 °C. тива Бенедикта.
4. Прокипятите в отдельной пробирке три 5. Пометьте этикеткой «pH 3» одну из проби
целые горошины, а затем поместите их рок и внесите в нее 2 мл раствора крахмала.
в одну из пробирок на водяной бане. 6. Добавьте в ту же пробирку 2 мл буферного
5. В другую пробирку на водяной бане поло раствора с pH 3 и тщательно перемешайте
жите три горошины, не подвергавшиеся оба раствора.
кипячению. 7. Прокипятите не менее 4 мл раствора фер
6. Выдержите пробирки в водяной бане в те мента и влейте 4 мл этого раствора в про
чение времени, достаточного для того, бирку с соответствующей этикеткой.
чтобы они приняли ее температуру (около 8. В другую пробирку, также снабженную
10 мин). этикеткой, влейте 4 мл раствора фермента,
7. Проверьте каждую из горошин на каталаз не подвергавшегося кипячению; поставьте
ную активность. все три пробирки в водяную баню и вы
ждите некоторое время (около 1 мин) для
8. Повторите тот же эксперимент при 50, 60,
того, чтобы они успели нагреться до 38 °C.
70, 80 и 100 °C.
9. Влейте небольшое количество реактива
9. Запишите ваши наблюдения и объясните
Бенедикта в каждую из 11 пробирок и по
полученные результаты.
метьте их цифрами 1—11. Следующие три
этапа должны быть проведены очень бы
Опыт 4.3. Изучение влияния различных значений pH стро.
на активность фермента 10. Когда растворы в водяной бане примут ее
температуру, влейте забуференный рас
твор крахмала в некипяченый раствор
Материалы и оборудование
фермента.
Реактив Бенедикта 11. Хорошо перемешайте оба раствора, пере
Буферные растворы с pH 3, 5, 7, 9 и 11
ворачивая пробирку, а затем снова по
1%ный раствор крахмала
ставьте пробирку в водяную баню.
Водяная баня с температурой 38 °C
Бунзеновская горелка 12. Включите отсчет времени и сразу же пере
Асбест несите небольшое количество реакцион
Держатель для пробирок, штатив с пробирками ной смеси (примерно равное по объему
Градуированные пипетки на 5 мл взятому реактиву Бенедикта) в пробирку 1.
Термометр 13. На протяжении всего опыта энергично
Таймер встряхивайте смесь.
162 Глава 4
14. По истечении 1 мин перенесите в пробир 4.4. Ингибирование ферментов
ку 2 вторую порцию реакционной смеси
(приблизительно того же объема, что и Известны различные низкомолекулярные
первая). соединения, которые могут снижать скорость
ферментативных реакций. Такие соединения
15. Повторяйте ту же процедуру с интервала называются ингибиторами ферментов. Важно по
ми 1 мин в течение еще 9 мин (т. е. запол нимать, что ингибирование — это один из нор
ните отобранными пробами пробирки мальных способов регулирования активности
3–11). ферментов. Многие лекарственные препараты и
16. Отметьте для пробирок 1–11 продолжи яды также действуют как ингибиторы фермен
тельность инкубации, требуемой для по тов. Ингибирование бывает конкурентным и
явления первых признаков положитель неконкурентным. Неконкурентное ингибирова
ной реакции Бенедикта (выпадения кир ние может быть обратимым и необратимым.
пичнокрасного осадка).
17. Повторите тот же опыт с прокипяченым 4.4.1. Конкурентное ингибирование
раствором фермента, начиная от п. 7.
В этом случае вещество, близкое по своей струк
18. Повторите весь опыт целиком с каждым из туре к обычному субстрату фермента, соединяет
остальных буферных растворов. ся с активным центром фермента, но не может
19. Постройте график зависимости времени прореагировать с ним. Находясь здесь, оно пре
гидролиза от pH и объясните полученные граждает доступ к активному центру любой мо
результаты. лекуле настоящего субстрата. Поскольку в этом
случае ингибитор и субстрат конкурируют за мес
Рис. 4.16. Строение одной из простетических групп — флавинадениндинуклеотида (ФАД). ФАД представляет
собой динуклеотид, образованный в результате соединения двух нуклеотидов. Нуклеотид состоит из сахара,
основания и фосфата. В данном случае нуклеотиды представлены флавинмононуклеотидом (ФМН) и аденозин
монофосфатом (АМФ). Обратите внимание, что в состав одного из нуклеотидов (ФМН) входит рибофлавин
(витамин В2 ). Этот витамин, следовательно, должен содержаться в рационе.
леза. Гем выполняет в организме ряд биологиче ческих групп они сохраняют связь с ферментом
ски важных функций. только в ходе реакции. Все коферменты пред
ПЕРЕНОС ЭЛЕКТРОНОВ. В качестве простетиче ставляют собой производные витаминов.
ской группы цитохромов (см. дыхательную
цепь в гл. 9) гем выступает как переносчик Никотинамидадениндинуклеотид (НАД)
электронов. Присоединяя электроны, железо (рис. 4.17)
восстанавливается до Fe(II), а отдавая их, окис
НАД — производное витамина ниацина («нико
ляется до Fe(III). Гем, следовательно, принима
тиновой кислоты») — может существовать как
ет участие в окислительновосстановительных
в окисленной, так и в восстановленной форме.
реакциях за счет обратимых изменений валент
В окисленной форме НАД при катализе играет
ности железа.
роль акцептора водорода:
ПЕРЕНОС КИСЛОРОДА. Гемоглобин и миогло
бин — два гемсодержащих белка, осуществляю
щих перенос кислорода. Железо находится в них
в восстановленной, Fe(II), форме (гл. 14).
КАТАЛИТИЧЕСКАЯ ФУНКЦИЯ. Гем входит в состав
каталаз и пероксидаз, катализирующих рас
щепление пероксида водорода до кислорода
и воды. Содержится он также и в некоторых где e1 и e2 — две разные дегидрогеназы.
других ферментах. Конечный результат: 2H переносятся от А
к В. Здесь в качестве связующего звена между
двумя различными ферментными системами e1
4.5.3. Коферменты (например, НАД, НАДФ, и e2 действует кофермент.
ацетилкофермент А, АТФ)
Коферменты, как и простетические группы, —
4.6. Перечислите характерные свойства
это органические молекулы, выполняющие
ферментов.
функцию кофакторов, но в отличие от простети
Ферменты 167
Рис. 4.17. Строение кофермента НАД (никотинамидадениндинуклеотида) и НАДФ (НАД с дополнительной фос
фатной группой). НАД и НАДФ представляют собой динуклеотиды (см. рис. 4.16). Обратите внимание, что ни
котинамид (ниацин), входящий в состав одного из нуклеотидов, является витамином. АМФ близок по своей
структуре к АТФ (в молекуле которого имеются две дополнительные фосфатные группы). АТФ служит в клет
ке носителем энергии. Он образуется в процессе клеточного дыхания.